Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

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Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNA1CQ13936 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNA1CQ13936 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNA1CQ13936 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNA1CQ13936 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA1CQ13936 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA1CQ13936 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA1CQ13936 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA1CQ13936 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA1CQ13936 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA1CQ13936 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA1CQ13936 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA1CQ13936 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA1CQ13936 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA1CQ13936 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA1CQ13936 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA1CQ13936 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA1CQ13936 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA1CQ13936 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA1CQ13936 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA1CQ13936 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNA1CQ13936 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNA1CQ13936 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNA1CQ13936 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNA1CQ13936 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNA1CQ13936 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNA1CQ13936 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNA1CQ13936 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNA1CQ13936 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNA1CQ13936 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNA1CQ13936 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNA1CQ13936 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNA1CQ13936 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNA1CQ13936 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNA1CQ13936 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNA1CQ13936 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNA1CQ13936 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNA1CQ13936 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNA1CQ13936 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CACNA1CQ13936 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CACNA1CQ13936 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CACNA1CQ13936 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CACNA1CQ13936 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CACNA1CQ13936 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CACNA1CQ13936 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CACNA1CQ13936 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CACNA1CQ13936 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CACNA1CQ13936 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CACNA1CQ13936 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CACNA1CQ13936 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CACNA1CQ13936 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CACNA1CQ13936 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CACNA1CQ13936 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CACNA1CQ13936 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNA1CQ13936 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNA1CQ13936 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNA1CQ13936 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNA1CQ13936 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNA1CQ13936 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNA1CQ13936 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNA1CQ13936 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNA1CQ13936 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNA1CQ13936 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNA1CQ13936 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNA1CQ13936 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNA1CQ13936 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNA1CQ13936 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNA1CQ13936 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNA1CQ13936 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNA1CQ13936 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNA1CQ13936 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNA1CQ13936 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNA1CQ13936 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNA1CQ13936 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNA1CQ13936 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNA1CQ13936 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNA1CQ13936 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNA1CQ13936 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNA1CQ13936 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNA1CQ13936 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNA1CQ13936 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNA1CQ13936 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNA1CQ13936 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNA1CQ13936 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNA1CQ13936 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNA1CQ13936 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNA1CQ13936 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNA1CQ13936 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNA1CQ13936 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNA1CQ13936 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNA1CQ13936 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNA1CQ13936 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNA1CQ13936 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNA1CQ13936 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNA1CQ13936 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNA1CQ13936 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNA1CQ13936 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNA1CQ13936 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNA1CQ13936 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNA1CQ13936 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
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