Protein–RNA interactions for Protein: Q13702

RAPSN, 43 kDa receptor-associated protein of the synapse, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPSNQ13702 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAPSNQ13702 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RAPSNQ13702 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAPSNQ13702 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAPSNQ13702 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAPSNQ13702 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAPSNQ13702 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAPSNQ13702 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAPSNQ13702 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAPSNQ13702 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAPSNQ13702 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAPSNQ13702 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAPSNQ13702 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAPSNQ13702 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAPSNQ13702 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAPSNQ13702 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAPSNQ13702 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAPSNQ13702 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAPSNQ13702 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAPSNQ13702 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAPSNQ13702 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAPSNQ13702 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAPSNQ13702 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAPSNQ13702 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAPSNQ13702 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RAPSNQ13702 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAPSNQ13702 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAPSNQ13702 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAPSNQ13702 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RAPSNQ13702 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAPSNQ13702 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAPSNQ13702 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RAPSNQ13702 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RAPSNQ13702 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAPSNQ13702 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAPSNQ13702 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAPSNQ13702 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAPSNQ13702 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAPSNQ13702 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAPSNQ13702 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAPSNQ13702 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RAPSNQ13702 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RAPSNQ13702 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAPSNQ13702 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAPSNQ13702 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAPSNQ13702 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAPSNQ13702 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAPSNQ13702 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RAPSNQ13702 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAPSNQ13702 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAPSNQ13702 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAPSNQ13702 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAPSNQ13702 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAPSNQ13702 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAPSNQ13702 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAPSNQ13702 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAPSNQ13702 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAPSNQ13702 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAPSNQ13702 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAPSNQ13702 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAPSNQ13702 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAPSNQ13702 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAPSNQ13702 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAPSNQ13702 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAPSNQ13702 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAPSNQ13702 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAPSNQ13702 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAPSNQ13702 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RAPSNQ13702 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAPSNQ13702 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAPSNQ13702 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAPSNQ13702 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAPSNQ13702 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAPSNQ13702 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAPSNQ13702 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RAPSNQ13702 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAPSNQ13702 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAPSNQ13702 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAPSNQ13702 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAPSNQ13702 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAPSNQ13702 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAPSNQ13702 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAPSNQ13702 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAPSNQ13702 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAPSNQ13702 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAPSNQ13702 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAPSNQ13702 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAPSNQ13702 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAPSNQ13702 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAPSNQ13702 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAPSNQ13702 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAPSNQ13702 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RAPSNQ13702 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAPSNQ13702 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAPSNQ13702 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAPSNQ13702 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAPSNQ13702 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAPSNQ13702 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAPSNQ13702 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAPSNQ13702 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87 ms