Protein–RNA interactions for Protein: Q13621

SLC12A1, Solute carrier family 12 member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,099 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A1Q13621 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC12A1Q13621 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC12A1Q13621 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC12A1Q13621 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC12A1Q13621 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC12A1Q13621 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC12A1Q13621 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC12A1Q13621 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC12A1Q13621 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC12A1Q13621 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC12A1Q13621 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC12A1Q13621 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC12A1Q13621 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC12A1Q13621 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC12A1Q13621 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC12A1Q13621 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC12A1Q13621 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC12A1Q13621 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC12A1Q13621 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC12A1Q13621 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC12A1Q13621 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC12A1Q13621 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC12A1Q13621 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC12A1Q13621 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC12A1Q13621 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC12A1Q13621 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC12A1Q13621 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC12A1Q13621 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC12A1Q13621 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC12A1Q13621 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC12A1Q13621 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC12A1Q13621 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC12A1Q13621 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC12A1Q13621 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC12A1Q13621 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC12A1Q13621 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC12A1Q13621 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC12A1Q13621 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC12A1Q13621 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC12A1Q13621 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC12A1Q13621 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC12A1Q13621 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC12A1Q13621 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC12A1Q13621 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC12A1Q13621 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC12A1Q13621 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC12A1Q13621 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC12A1Q13621 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC12A1Q13621 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC12A1Q13621 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC12A1Q13621 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC12A1Q13621 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC12A1Q13621 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC12A1Q13621 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC12A1Q13621 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC12A1Q13621 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC12A1Q13621 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC12A1Q13621 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC12A1Q13621 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC12A1Q13621 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC12A1Q13621 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC12A1Q13621 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC12A1Q13621 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC12A1Q13621 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC12A1Q13621 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC12A1Q13621 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC12A1Q13621 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC12A1Q13621 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC12A1Q13621 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC12A1Q13621 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC12A1Q13621 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC12A1Q13621 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC12A1Q13621 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC12A1Q13621 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC12A1Q13621 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC12A1Q13621 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC12A1Q13621 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC12A1Q13621 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC12A1Q13621 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC12A1Q13621 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC12A1Q13621 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC12A1Q13621 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC12A1Q13621 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC12A1Q13621 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC12A1Q13621 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC12A1Q13621 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC12A1Q13621 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC12A1Q13621 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC12A1Q13621 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC12A1Q13621 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC12A1Q13621 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC12A1Q13621 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC12A1Q13621 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC12A1Q13621 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC12A1Q13621 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC12A1Q13621 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC12A1Q13621 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC12A1Q13621 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC12A1Q13621 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC12A1Q13621 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms