Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTMR3Q13615 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTMR3Q13615 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
MTMR3Q13615 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTMR3Q13615 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTMR3Q13615 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTMR3Q13615 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTMR3Q13615 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTMR3Q13615 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTMR3Q13615 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTMR3Q13615 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTMR3Q13615 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MTMR3Q13615 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MTMR3Q13615 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MTMR3Q13615 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MTMR3Q13615 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MTMR3Q13615 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MTMR3Q13615 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MTMR3Q13615 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MTMR3Q13615 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MTMR3Q13615 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MTMR3Q13615 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MTMR3Q13615 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MTMR3Q13615 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
MTMR3Q13615 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MTMR3Q13615 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MTMR3Q13615 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MTMR3Q13615 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MTMR3Q13615 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MTMR3Q13615 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MTMR3Q13615 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MTMR3Q13615 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
MTMR3Q13615 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MTMR3Q13615 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
MTMR3Q13615 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MTMR3Q13615 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
MTMR3Q13615 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MTMR3Q13615 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MTMR3Q13615 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MTMR3Q13615 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MTMR3Q13615 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MTMR3Q13615 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
MTMR3Q13615 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
MTMR3Q13615 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MTMR3Q13615 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MTMR3Q13615 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MTMR3Q13615 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MTMR3Q13615 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MTMR3Q13615 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
MTMR3Q13615 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
MTMR3Q13615 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MTMR3Q13615 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MTMR3Q13615 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MTMR3Q13615 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MTMR3Q13615 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MTMR3Q13615 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MTMR3Q13615 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MTMR3Q13615 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MTMR3Q13615 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MTMR3Q13615 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MTMR3Q13615 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MTMR3Q13615 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MTMR3Q13615 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MTMR3Q13615 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MTMR3Q13615 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MTMR3Q13615 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MTMR3Q13615 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MTMR3Q13615 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MTMR3Q13615 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MTMR3Q13615 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MTMR3Q13615 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MTMR3Q13615 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MTMR3Q13615 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MTMR3Q13615 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MTMR3Q13615 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MTMR3Q13615 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MTMR3Q13615 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MTMR3Q13615 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MTMR3Q13615 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MTMR3Q13615 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MTMR3Q13615 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MTMR3Q13615 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MTMR3Q13615 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MTMR3Q13615 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MTMR3Q13615 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MTMR3Q13615 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MTMR3Q13615 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MTMR3Q13615 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MTMR3Q13615 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MTMR3Q13615 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MTMR3Q13615 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MTMR3Q13615 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MTMR3Q13615 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MTMR3Q13615 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MTMR3Q13615 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MTMR3Q13615 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MTMR3Q13615 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MTMR3Q13615 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MTMR3Q13615 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MTMR3Q13615 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
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