Protein–RNA interactions for Protein: Q13480

GAB1, GRB2-associated-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAB1Q13480 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GAB1Q13480 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GAB1Q13480 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GAB1Q13480 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GAB1Q13480 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GAB1Q13480 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
GAB1Q13480 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GAB1Q13480 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GAB1Q13480 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GAB1Q13480 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GAB1Q13480 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GAB1Q13480 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GAB1Q13480 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GAB1Q13480 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GAB1Q13480 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GAB1Q13480 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GAB1Q13480 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GAB1Q13480 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GAB1Q13480 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GAB1Q13480 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GAB1Q13480 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GAB1Q13480 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GAB1Q13480 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GAB1Q13480 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GAB1Q13480 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GAB1Q13480 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GAB1Q13480 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GAB1Q13480 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
GAB1Q13480 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GAB1Q13480 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GAB1Q13480 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
GAB1Q13480 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GAB1Q13480 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GAB1Q13480 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GAB1Q13480 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GAB1Q13480 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GAB1Q13480 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GAB1Q13480 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GAB1Q13480 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GAB1Q13480 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GAB1Q13480 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GAB1Q13480 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GAB1Q13480 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GAB1Q13480 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GAB1Q13480 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GAB1Q13480 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GAB1Q13480 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GAB1Q13480 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GAB1Q13480 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GAB1Q13480 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GAB1Q13480 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GAB1Q13480 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GAB1Q13480 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GAB1Q13480 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GAB1Q13480 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GAB1Q13480 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GAB1Q13480 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GAB1Q13480 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GAB1Q13480 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GAB1Q13480 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GAB1Q13480 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GAB1Q13480 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GAB1Q13480 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GAB1Q13480 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GAB1Q13480 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GAB1Q13480 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GAB1Q13480 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GAB1Q13480 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GAB1Q13480 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GAB1Q13480 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GAB1Q13480 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GAB1Q13480 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GAB1Q13480 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GAB1Q13480 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GAB1Q13480 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GAB1Q13480 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GAB1Q13480 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GAB1Q13480 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GAB1Q13480 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GAB1Q13480 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GAB1Q13480 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GAB1Q13480 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GAB1Q13480 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GAB1Q13480 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GAB1Q13480 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GAB1Q13480 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GAB1Q13480 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GAB1Q13480 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GAB1Q13480 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GAB1Q13480 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GAB1Q13480 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GAB1Q13480 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GAB1Q13480 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GAB1Q13480 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GAB1Q13480 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GAB1Q13480 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GAB1Q13480 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GAB1Q13480 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GAB1Q13480 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GAB1Q13480 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms