Protein–RNA interactions for Protein: Q13422

IKZF1, DNA-binding protein Ikaros, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKZF1Q13422 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IKZF1Q13422 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
IKZF1Q13422 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
IKZF1Q13422 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
IKZF1Q13422 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
IKZF1Q13422 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
IKZF1Q13422 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
IKZF1Q13422 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
IKZF1Q13422 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
IKZF1Q13422 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
IKZF1Q13422 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
IKZF1Q13422 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
IKZF1Q13422 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
IKZF1Q13422 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
IKZF1Q13422 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
IKZF1Q13422 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
IKZF1Q13422 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
IKZF1Q13422 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
IKZF1Q13422 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
IKZF1Q13422 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
IKZF1Q13422 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
IKZF1Q13422 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
IKZF1Q13422 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
IKZF1Q13422 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
IKZF1Q13422 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
IKZF1Q13422 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
IKZF1Q13422 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
IKZF1Q13422 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
IKZF1Q13422 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
IKZF1Q13422 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
IKZF1Q13422 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
IKZF1Q13422 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
IKZF1Q13422 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
IKZF1Q13422 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
IKZF1Q13422 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
IKZF1Q13422 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
IKZF1Q13422 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
IKZF1Q13422 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
IKZF1Q13422 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
IKZF1Q13422 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
IKZF1Q13422 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
IKZF1Q13422 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
IKZF1Q13422 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
IKZF1Q13422 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
IKZF1Q13422 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
IKZF1Q13422 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
IKZF1Q13422 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
IKZF1Q13422 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
IKZF1Q13422 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
IKZF1Q13422 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
IKZF1Q13422 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
IKZF1Q13422 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
IKZF1Q13422 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
IKZF1Q13422 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
IKZF1Q13422 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
IKZF1Q13422 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
IKZF1Q13422 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
IKZF1Q13422 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
IKZF1Q13422 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
IKZF1Q13422 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
IKZF1Q13422 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
IKZF1Q13422 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
IKZF1Q13422 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
IKZF1Q13422 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
IKZF1Q13422 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
IKZF1Q13422 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
IKZF1Q13422 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.7
IKZF1Q13422 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
IKZF1Q13422 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
IKZF1Q13422 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
IKZF1Q13422 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
IKZF1Q13422 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
IKZF1Q13422 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
IKZF1Q13422 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
IKZF1Q13422 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
IKZF1Q13422 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
IKZF1Q13422 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
IKZF1Q13422 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
IKZF1Q13422 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
IKZF1Q13422 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
IKZF1Q13422 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
IKZF1Q13422 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
IKZF1Q13422 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
IKZF1Q13422 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
IKZF1Q13422 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
IKZF1Q13422 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
IKZF1Q13422 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
IKZF1Q13422 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
IKZF1Q13422 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
IKZF1Q13422 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
IKZF1Q13422 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
IKZF1Q13422 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
IKZF1Q13422 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
IKZF1Q13422 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
IKZF1Q13422 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
IKZF1Q13422 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
IKZF1Q13422 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
IKZF1Q13422 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
IKZF1Q13422 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
IKZF1Q13422 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms