Protein–RNA interactions for Protein: Q13393

PLD1, Phospholipase D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD1Q13393 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PLD1Q13393 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PLD1Q13393 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PLD1Q13393 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PLD1Q13393 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PLD1Q13393 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PLD1Q13393 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PLD1Q13393 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PLD1Q13393 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PLD1Q13393 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PLD1Q13393 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PLD1Q13393 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PLD1Q13393 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PLD1Q13393 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PLD1Q13393 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PLD1Q13393 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PLD1Q13393 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PLD1Q13393 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PLD1Q13393 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PLD1Q13393 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PLD1Q13393 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PLD1Q13393 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PLD1Q13393 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PLD1Q13393 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PLD1Q13393 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PLD1Q13393 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PLD1Q13393 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PLD1Q13393 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PLD1Q13393 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PLD1Q13393 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PLD1Q13393 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PLD1Q13393 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PLD1Q13393 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PLD1Q13393 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PLD1Q13393 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PLD1Q13393 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PLD1Q13393 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PLD1Q13393 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PLD1Q13393 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PLD1Q13393 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PLD1Q13393 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PLD1Q13393 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PLD1Q13393 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PLD1Q13393 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PLD1Q13393 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PLD1Q13393 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PLD1Q13393 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PLD1Q13393 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PLD1Q13393 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLD1Q13393 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLD1Q13393 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLD1Q13393 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLD1Q13393 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLD1Q13393 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLD1Q13393 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLD1Q13393 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLD1Q13393 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLD1Q13393 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLD1Q13393 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLD1Q13393 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PLD1Q13393 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PLD1Q13393 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PLD1Q13393 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PLD1Q13393 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PLD1Q13393 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PLD1Q13393 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PLD1Q13393 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PLD1Q13393 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PLD1Q13393 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PLD1Q13393 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PLD1Q13393 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PLD1Q13393 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PLD1Q13393 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PLD1Q13393 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PLD1Q13393 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PLD1Q13393 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLD1Q13393 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLD1Q13393 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLD1Q13393 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLD1Q13393 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLD1Q13393 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLD1Q13393 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLD1Q13393 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLD1Q13393 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLD1Q13393 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLD1Q13393 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLD1Q13393 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLD1Q13393 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PLD1Q13393 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLD1Q13393 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLD1Q13393 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PLD1Q13393 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLD1Q13393 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLD1Q13393 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLD1Q13393 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLD1Q13393 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLD1Q13393 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLD1Q13393 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLD1Q13393 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLD1Q13393 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms