Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGB3BPQ13352 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGB3BPQ13352 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGB3BPQ13352 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGB3BPQ13352 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGB3BPQ13352 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGB3BPQ13352 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGB3BPQ13352 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGB3BPQ13352 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGB3BPQ13352 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGB3BPQ13352 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGB3BPQ13352 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGB3BPQ13352 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGB3BPQ13352 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGB3BPQ13352 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGB3BPQ13352 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGB3BPQ13352 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGB3BPQ13352 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGB3BPQ13352 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGB3BPQ13352 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGB3BPQ13352 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGB3BPQ13352 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGB3BPQ13352 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGB3BPQ13352 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGB3BPQ13352 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGB3BPQ13352 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGB3BPQ13352 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGB3BPQ13352 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGB3BPQ13352 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGB3BPQ13352 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGB3BPQ13352 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGB3BPQ13352 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGB3BPQ13352 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGB3BPQ13352 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGB3BPQ13352 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGB3BPQ13352 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGB3BPQ13352 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGB3BPQ13352 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGB3BPQ13352 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGB3BPQ13352 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGB3BPQ13352 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGB3BPQ13352 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGB3BPQ13352 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGB3BPQ13352 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGB3BPQ13352 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGB3BPQ13352 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGB3BPQ13352 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGB3BPQ13352 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGB3BPQ13352 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGB3BPQ13352 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGB3BPQ13352 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGB3BPQ13352 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGB3BPQ13352 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGB3BPQ13352 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGB3BPQ13352 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGB3BPQ13352 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGB3BPQ13352 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGB3BPQ13352 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGB3BPQ13352 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGB3BPQ13352 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGB3BPQ13352 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGB3BPQ13352 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGB3BPQ13352 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGB3BPQ13352 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGB3BPQ13352 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGB3BPQ13352 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGB3BPQ13352 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGB3BPQ13352 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGB3BPQ13352 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGB3BPQ13352 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGB3BPQ13352 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGB3BPQ13352 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGB3BPQ13352 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGB3BPQ13352 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGB3BPQ13352 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGB3BPQ13352 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGB3BPQ13352 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGB3BPQ13352 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGB3BPQ13352 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGB3BPQ13352 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGB3BPQ13352 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGB3BPQ13352 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGB3BPQ13352 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGB3BPQ13352 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGB3BPQ13352 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGB3BPQ13352 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGB3BPQ13352 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGB3BPQ13352 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGB3BPQ13352 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGB3BPQ13352 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGB3BPQ13352 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGB3BPQ13352 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ITGB3BPQ13352 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ITGB3BPQ13352 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITGB3BPQ13352 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITGB3BPQ13352 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITGB3BPQ13352 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITGB3BPQ13352 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITGB3BPQ13352 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITGB3BPQ13352 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
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