Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SGCGQ13326 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SGCGQ13326 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SGCGQ13326 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGCGQ13326 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGCGQ13326 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGCGQ13326 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGCGQ13326 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGCGQ13326 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGCGQ13326 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGCGQ13326 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGCGQ13326 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGCGQ13326 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGCGQ13326 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGCGQ13326 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGCGQ13326 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGCGQ13326 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGCGQ13326 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGCGQ13326 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGCGQ13326 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGCGQ13326 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SGCGQ13326 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGCGQ13326 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGCGQ13326 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGCGQ13326 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGCGQ13326 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGCGQ13326 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGCGQ13326 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGCGQ13326 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGCGQ13326 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGCGQ13326 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGCGQ13326 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGCGQ13326 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGCGQ13326 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGCGQ13326 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGCGQ13326 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGCGQ13326 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGCGQ13326 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGCGQ13326 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGCGQ13326 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGCGQ13326 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGCGQ13326 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGCGQ13326 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGCGQ13326 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SGCGQ13326 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGCGQ13326 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGCGQ13326 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGCGQ13326 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGCGQ13326 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGCGQ13326 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGCGQ13326 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGCGQ13326 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SGCGQ13326 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SGCGQ13326 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SGCGQ13326 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SGCGQ13326 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SGCGQ13326 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SGCGQ13326 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SGCGQ13326 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SGCGQ13326 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SGCGQ13326 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SGCGQ13326 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SGCGQ13326 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SGCGQ13326 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SGCGQ13326 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SGCGQ13326 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SGCGQ13326 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SGCGQ13326 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SGCGQ13326 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SGCGQ13326 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SGCGQ13326 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SGCGQ13326 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SGCGQ13326 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SGCGQ13326 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SGCGQ13326 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SGCGQ13326 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SGCGQ13326 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SGCGQ13326 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SGCGQ13326 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SGCGQ13326 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SGCGQ13326 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SGCGQ13326 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SGCGQ13326 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SGCGQ13326 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SGCGQ13326 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGCGQ13326 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGCGQ13326 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGCGQ13326 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGCGQ13326 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGCGQ13326 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SGCGQ13326 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGCGQ13326 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGCGQ13326 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGCGQ13326 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGCGQ13326 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGCGQ13326 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGCGQ13326 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGCGQ13326 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGCGQ13326 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGCGQ13326 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
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