Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATMQ13315 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATMQ13315 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATMQ13315 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATMQ13315 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATMQ13315 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATMQ13315 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATMQ13315 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATMQ13315 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATMQ13315 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ATMQ13315 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATMQ13315 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ATMQ13315 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
ATMQ13315 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATMQ13315 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATMQ13315 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATMQ13315 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATMQ13315 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATMQ13315 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATMQ13315 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATMQ13315 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATMQ13315 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATMQ13315 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATMQ13315 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATMQ13315 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATMQ13315 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
ATMQ13315 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATMQ13315 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
ATMQ13315 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATMQ13315 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATMQ13315 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
ATMQ13315 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATMQ13315 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATMQ13315 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATMQ13315 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATMQ13315 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATMQ13315 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATMQ13315 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATMQ13315 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATMQ13315 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATMQ13315 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATMQ13315 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATMQ13315 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATMQ13315 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATMQ13315 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATMQ13315 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATMQ13315 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATMQ13315 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATMQ13315 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATMQ13315 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATMQ13315 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATMQ13315 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATMQ13315 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATMQ13315 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
ATMQ13315 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATMQ13315 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATMQ13315 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATMQ13315 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATMQ13315 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATMQ13315 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATMQ13315 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATMQ13315 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATMQ13315 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATMQ13315 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATMQ13315 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATMQ13315 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
ATMQ13315 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATMQ13315 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
ATMQ13315 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATMQ13315 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATMQ13315 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATMQ13315 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATMQ13315 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATMQ13315 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATMQ13315 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATMQ13315 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATMQ13315 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATMQ13315 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATMQ13315 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATMQ13315 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATMQ13315 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATMQ13315 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATMQ13315 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATMQ13315 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATMQ13315 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATMQ13315 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATMQ13315 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATMQ13315 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATMQ13315 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATMQ13315 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATMQ13315 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATMQ13315 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATMQ13315 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATMQ13315 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATMQ13315 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATMQ13315 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATMQ13315 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATMQ13315 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
ATMQ13315 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATMQ13315 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
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