Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
SRSF6Q13247 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SRSF6Q13247 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SRSF6Q13247 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SRSF6Q13247 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SRSF6Q13247 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SRSF6Q13247 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SRSF6Q13247 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SRSF6Q13247 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SRSF6Q13247 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SRSF6Q13247 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SRSF6Q13247 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SRSF6Q13247 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SRSF6Q13247 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SRSF6Q13247 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SRSF6Q13247 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SRSF6Q13247 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SRSF6Q13247 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SRSF6Q13247 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SRSF6Q13247 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SRSF6Q13247 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SRSF6Q13247 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SRSF6Q13247 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SRSF6Q13247 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SRSF6Q13247 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SRSF6Q13247 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SRSF6Q13247 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SRSF6Q13247 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SRSF6Q13247 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SRSF6Q13247 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SRSF6Q13247 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SRSF6Q13247 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SRSF6Q13247 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SRSF6Q13247 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SRSF6Q13247 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SRSF6Q13247 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SRSF6Q13247 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SRSF6Q13247 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SRSF6Q13247 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SRSF6Q13247 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SRSF6Q13247 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SRSF6Q13247 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SRSF6Q13247 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SRSF6Q13247 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SRSF6Q13247 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SRSF6Q13247 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SRSF6Q13247 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SRSF6Q13247 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SRSF6Q13247 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SRSF6Q13247 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SRSF6Q13247 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SRSF6Q13247 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SRSF6Q13247 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SRSF6Q13247 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SRSF6Q13247 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SRSF6Q13247 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
SRSF6Q13247 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SRSF6Q13247 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SRSF6Q13247 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SRSF6Q13247 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SRSF6Q13247 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SRSF6Q13247 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SRSF6Q13247 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SRSF6Q13247 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SRSF6Q13247 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SRSF6Q13247 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SRSF6Q13247 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SRSF6Q13247 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SRSF6Q13247 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SRSF6Q13247 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SRSF6Q13247 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SRSF6Q13247 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SRSF6Q13247 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SRSF6Q13247 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SRSF6Q13247 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SRSF6Q13247 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SRSF6Q13247 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SRSF6Q13247 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SRSF6Q13247 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SRSF6Q13247 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SRSF6Q13247 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SRSF6Q13247 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SRSF6Q13247 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SRSF6Q13247 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SRSF6Q13247 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SRSF6Q13247 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SRSF6Q13247 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SRSF6Q13247 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SRSF6Q13247 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SRSF6Q13247 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SRSF6Q13247 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SRSF6Q13247 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SRSF6Q13247 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SRSF6Q13247 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SRSF6Q13247 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SRSF6Q13247 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SRSF6Q13247 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SRSF6Q13247 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SRSF6Q13247 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SRSF6Q13247 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
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