Protein–RNA interactions for Protein: Q13228

SELENBP1, Selenium-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENBP1Q13228 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SELENBP1Q13228 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SELENBP1Q13228 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SELENBP1Q13228 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SELENBP1Q13228 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SELENBP1Q13228 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SELENBP1Q13228 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SELENBP1Q13228 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SELENBP1Q13228 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SELENBP1Q13228 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SELENBP1Q13228 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SELENBP1Q13228 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SELENBP1Q13228 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SELENBP1Q13228 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SELENBP1Q13228 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SELENBP1Q13228 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
SELENBP1Q13228 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SELENBP1Q13228 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SELENBP1Q13228 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SELENBP1Q13228 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SELENBP1Q13228 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SELENBP1Q13228 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SELENBP1Q13228 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SELENBP1Q13228 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SELENBP1Q13228 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SELENBP1Q13228 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SELENBP1Q13228 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SELENBP1Q13228 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SELENBP1Q13228 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SELENBP1Q13228 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SELENBP1Q13228 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SELENBP1Q13228 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SELENBP1Q13228 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SELENBP1Q13228 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SELENBP1Q13228 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SELENBP1Q13228 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SELENBP1Q13228 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SELENBP1Q13228 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SELENBP1Q13228 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SELENBP1Q13228 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SELENBP1Q13228 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SELENBP1Q13228 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SELENBP1Q13228 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SELENBP1Q13228 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SELENBP1Q13228 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SELENBP1Q13228 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SELENBP1Q13228 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SELENBP1Q13228 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SELENBP1Q13228 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SELENBP1Q13228 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SELENBP1Q13228 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SELENBP1Q13228 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SELENBP1Q13228 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SELENBP1Q13228 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SELENBP1Q13228 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SELENBP1Q13228 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SELENBP1Q13228 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SELENBP1Q13228 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SELENBP1Q13228 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SELENBP1Q13228 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SELENBP1Q13228 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SELENBP1Q13228 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SELENBP1Q13228 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SELENBP1Q13228 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SELENBP1Q13228 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SELENBP1Q13228 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SELENBP1Q13228 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SELENBP1Q13228 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SELENBP1Q13228 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SELENBP1Q13228 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SELENBP1Q13228 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SELENBP1Q13228 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SELENBP1Q13228 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SELENBP1Q13228 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SELENBP1Q13228 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SELENBP1Q13228 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SELENBP1Q13228 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SELENBP1Q13228 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SELENBP1Q13228 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SELENBP1Q13228 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SELENBP1Q13228 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SELENBP1Q13228 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SELENBP1Q13228 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SELENBP1Q13228 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SELENBP1Q13228 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SELENBP1Q13228 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SELENBP1Q13228 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SELENBP1Q13228 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SELENBP1Q13228 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SELENBP1Q13228 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SELENBP1Q13228 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SELENBP1Q13228 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SELENBP1Q13228 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SELENBP1Q13228 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SELENBP1Q13228 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SELENBP1Q13228 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SELENBP1Q13228 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SELENBP1Q13228 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SELENBP1Q13228 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SELENBP1Q13228 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms