Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAF1Q13077 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAF1Q13077 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAF1Q13077 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAF1Q13077 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAF1Q13077 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAF1Q13077 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAF1Q13077 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAF1Q13077 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAF1Q13077 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAF1Q13077 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAF1Q13077 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAF1Q13077 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAF1Q13077 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAF1Q13077 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TRAF1Q13077 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRAF1Q13077 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRAF1Q13077 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRAF1Q13077 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRAF1Q13077 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRAF1Q13077 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
TRAF1Q13077 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
TRAF1Q13077 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRAF1Q13077 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRAF1Q13077 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRAF1Q13077 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRAF1Q13077 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRAF1Q13077 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAF1Q13077 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAF1Q13077 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAF1Q13077 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAF1Q13077 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAF1Q13077 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAF1Q13077 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAF1Q13077 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAF1Q13077 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAF1Q13077 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAF1Q13077 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAF1Q13077 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAF1Q13077 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAF1Q13077 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAF1Q13077 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAF1Q13077 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAF1Q13077 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAF1Q13077 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAF1Q13077 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAF1Q13077 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAF1Q13077 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAF1Q13077 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAF1Q13077 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAF1Q13077 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAF1Q13077 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAF1Q13077 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAF1Q13077 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRAF1Q13077 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRAF1Q13077 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRAF1Q13077 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRAF1Q13077 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRAF1Q13077 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TRAF1Q13077 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRAF1Q13077 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TRAF1Q13077 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRAF1Q13077 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TRAF1Q13077 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TRAF1Q13077 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRAF1Q13077 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRAF1Q13077 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRAF1Q13077 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRAF1Q13077 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRAF1Q13077 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRAF1Q13077 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRAF1Q13077 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRAF1Q13077 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRAF1Q13077 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRAF1Q13077 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRAF1Q13077 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRAF1Q13077 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TRAF1Q13077 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRAF1Q13077 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRAF1Q13077 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRAF1Q13077 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRAF1Q13077 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRAF1Q13077 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRAF1Q13077 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRAF1Q13077 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRAF1Q13077 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRAF1Q13077 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRAF1Q13077 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRAF1Q13077 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRAF1Q13077 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRAF1Q13077 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TRAF1Q13077 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRAF1Q13077 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRAF1Q13077 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRAF1Q13077 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRAF1Q13077 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRAF1Q13077 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRAF1Q13077 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAF1Q13077 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAF1Q13077 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
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