Protein–RNA interactions for Protein: Q12908

SLC10A2, Ileal sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A2Q12908 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC10A2Q12908 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC10A2Q12908 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC10A2Q12908 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC10A2Q12908 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC10A2Q12908 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC10A2Q12908 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC10A2Q12908 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC10A2Q12908 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC10A2Q12908 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC10A2Q12908 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC10A2Q12908 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC10A2Q12908 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC10A2Q12908 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC10A2Q12908 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC10A2Q12908 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC10A2Q12908 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC10A2Q12908 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC10A2Q12908 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC10A2Q12908 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC10A2Q12908 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC10A2Q12908 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC10A2Q12908 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC10A2Q12908 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC10A2Q12908 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC10A2Q12908 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC10A2Q12908 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC10A2Q12908 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC10A2Q12908 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC10A2Q12908 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC10A2Q12908 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC10A2Q12908 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC10A2Q12908 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC10A2Q12908 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC10A2Q12908 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC10A2Q12908 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC10A2Q12908 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC10A2Q12908 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC10A2Q12908 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC10A2Q12908 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC10A2Q12908 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC10A2Q12908 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC10A2Q12908 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC10A2Q12908 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC10A2Q12908 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC10A2Q12908 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC10A2Q12908 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC10A2Q12908 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC10A2Q12908 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC10A2Q12908 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC10A2Q12908 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC10A2Q12908 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC10A2Q12908 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC10A2Q12908 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC10A2Q12908 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC10A2Q12908 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC10A2Q12908 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC10A2Q12908 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC10A2Q12908 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC10A2Q12908 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC10A2Q12908 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC10A2Q12908 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC10A2Q12908 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC10A2Q12908 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC10A2Q12908 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC10A2Q12908 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC10A2Q12908 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC10A2Q12908 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC10A2Q12908 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC10A2Q12908 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC10A2Q12908 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC10A2Q12908 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC10A2Q12908 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC10A2Q12908 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC10A2Q12908 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC10A2Q12908 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC10A2Q12908 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC10A2Q12908 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC10A2Q12908 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC10A2Q12908 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC10A2Q12908 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC10A2Q12908 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC10A2Q12908 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC10A2Q12908 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC10A2Q12908 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC10A2Q12908 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC10A2Q12908 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC10A2Q12908 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC10A2Q12908 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC10A2Q12908 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC10A2Q12908 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC10A2Q12908 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC10A2Q12908 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC10A2Q12908 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC10A2Q12908 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC10A2Q12908 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC10A2Q12908 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC10A2Q12908 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC10A2Q12908 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC10A2Q12908 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
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