Protein–RNA interactions for Protein: Q12266

TY1A-BL, Transposon Ty1-BL Gag polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-BLQ12266 YGL007C-AYGL007C-A 87 nt6.31□□□□□ -1.4
TY1A-BLQ12266 DSE2YHR143W 978 nt6.31□□□□□ -1.4
TY1A-BLQ12266 KRE9YJL174W 831 nt6.31□□□□□ -1.4
TY1A-BLQ12266 YAL069WYAL069W 315 nt6.31□□□□□ -1.4
TY1A-BLQ12266 PHO85YPL031C 918 nt6.31□□□□□ -1.4
TY1A-BLQ12266 POP7YBR167C 423 nt6.31□□□□□ -1.4
TY1A-BLQ12266 NMD5YJR132W 3147 nt6.31□□□□□ -1.4
TY1A-BLQ12266 GCD1YOR260W 1737 nt6.3□□□□□ -1.4
TY1A-BLQ12266 MAD3YJL013C 1548 nt6.3□□□□□ -1.4
TY1A-BLQ12266 YMR018WYMR018W 1545 nt6.3□□□□□ -1.4
TY1A-BLQ12266 EXG1YLR300W 1347 nt6.3□□□□□ -1.4
TY1A-BLQ12266 HST3YOR025W 1344 nt6.3□□□□□ -1.4
TY1A-BLQ12266 RPT4YOR259C 1314 nt6.3□□□□□ -1.4
TY1A-BLQ12266 YNL247WYNL247W 2304 nt6.3□□□□□ -1.4
TY1A-BLQ12266 YDR271CYDR271C 372 nt6.3□□□□□ -1.4
TY1A-BLQ12266 SUF3tG(CCC)D 72 nt6.3□□□□□ -1.4
TY1A-BLQ12266 RTT105YER104W 627 nt6.3□□□□□ -1.4
TY1A-BLQ12266 AML1YGR001C 747 nt6.3□□□□□ -1.4
TY1A-BLQ12266 PEX4YGR133W 552 nt6.3□□□□□ -1.4
TY1A-BLQ12266 NTG1YAL015C 1200 nt6.3□□□□□ -1.4
TY1A-BLQ12266 YJL127C-BYJL127C-B 159 nt6.3□□□□□ -1.4
TY1A-BLQ12266 BER1YLR412W 825 nt6.3□□□□□ -1.4
TY1A-BLQ12266 CMC2YBL059C-A 330 nt6.3□□□□□ -1.4
TY1A-BLQ12266 NGL1YOL042W 1092 nt6.3□□□□□ -1.4
TY1A-BLQ12266 YPQ1YOL092W 927 nt6.3□□□□□ -1.4
TY1A-BLQ12266 YOR231C-AYOR231C-A 201 nt6.3□□□□□ -1.4
TY1A-BLQ12266 YPR015CYPR015C 744 nt6.3□□□□□ -1.4
TY1A-BLQ12266 HFD1YMR110C 1599 nt6.3□□□□□ -1.4
TY1A-BLQ12266 RAD57YDR004W 1383 nt6.3□□□□□ -1.4
TY1A-BLQ12266 HMRA2YCR096C 360 nt6.29□□□□□ -1.4
TY1A-BLQ12266 BUD25YER014C-A 462 nt6.29□□□□□ -1.4
TY1A-BLQ12266 SPT15YER148W 723 nt6.29□□□□□ -1.4
TY1A-BLQ12266 YGL109WYGL109W 324 nt6.29□□□□□ -1.4
TY1A-BLQ12266 YGL204CYGL204C 306 nt6.29□□□□□ -1.4
TY1A-BLQ12266 OST5YGL226C-A 261 nt6.29□□□□□ -1.4
TY1A-BLQ12266 SPO13YHR014W 876 nt6.29□□□□□ -1.4
TY1A-BLQ12266 PIH1YHR034C 1035 nt6.29□□□□□ -1.4
TY1A-BLQ12266 YKL063CYKL063C 504 nt6.29□□□□□ -1.4
TY1A-BLQ12266 YMR158C-AYMR158C-A 138 nt6.29□□□□□ -1.4
TY1A-BLQ12266 RBL2YOR265W 321 nt6.29□□□□□ -1.4
TY1A-BLQ12266 YBR062CYBR062C 543 nt6.29□□□□□ -1.4
TY1A-BLQ12266 ARR2YPR200C 393 nt6.29□□□□□ -1.4
TY1A-BLQ12266 FBP26YJL155C 1359 nt6.29□□□□□ -1.4
TY1A-BLQ12266 TDP1YBR223C 1635 nt6.28□□□□□ -1.4
TY1A-BLQ12266 TRM82YDR165W 1335 nt6.28□□□□□ -1.4
TY1A-BLQ12266 MEI4YER044C-A 1227 nt6.28□□□□□ -1.4
TY1A-BLQ12266 PET117YER058W 324 nt6.28□□□□□ -1.4
TY1A-BLQ12266 MAM1YER106W 909 nt6.28□□□□□ -1.4
TY1A-BLQ12266 YER134CYER134C 537 nt6.28□□□□□ -1.4
TY1A-BLQ12266 TOS8YGL096W 831 nt6.28□□□□□ -1.4
TY1A-BLQ12266 YGR045CYGR045C 363 nt6.28□□□□□ -1.4
TY1A-BLQ12266 Q0143Q0143 153 nt6.28□□□□□ -1.4
TY1A-BLQ12266 ARP1YHR129C 1155 nt6.28□□□□□ -1.4
TY1A-BLQ12266 PRM10YJL108C 1152 nt6.28□□□□□ -1.4
TY1A-BLQ12266 YKL071WYKL071W 771 nt6.28□□□□□ -1.4
TY1A-BLQ12266 PIR3YKL163W 978 nt6.28□□□□□ -1.4
TY1A-BLQ12266 YPT52YKR014C 705 nt6.28□□□□□ -1.4
TY1A-BLQ12266 YML122CYML122C 381 nt6.28□□□□□ -1.4
TY1A-BLQ12266 SNO1YMR095C 675 nt6.28□□□□□ -1.4
TY1A-BLQ12266 YBL094CYBL094C 333 nt6.28□□□□□ -1.4
TY1A-BLQ12266 PEP12YOR036W 867 nt6.28□□□□□ -1.4
TY1A-BLQ12266 CSM4YPL200W 471 nt6.28□□□□□ -1.4
TY1A-BLQ12266 CDC28YBR160W 897 nt6.28□□□□□ -1.4
TY1A-BLQ12266 AMN1YBR158W 1650 nt6.28□□□□□ -1.4
TY1A-BLQ12266 TAH11YJR046W 1815 nt6.27□□□□□ -1.41
TY1A-BLQ12266 EDC3YEL015W 1656 nt6.27□□□□□ -1.41
TY1A-BLQ12266 TRM13YOL125W 1431 nt6.27□□□□□ -1.41
TY1A-BLQ12266 ERS1YCR075C 783 nt6.27□□□□□ -1.41
TY1A-BLQ12266 BUD30YDL151C 582 nt6.27□□□□□ -1.41
TY1A-BLQ12266 DOS2YDR068W 933 nt6.27□□□□□ -1.41
TY1A-BLQ12266 HRI1YLR301W 735 nt6.27□□□□□ -1.41
TY1A-BLQ12266 ECM19YLR390W 339 nt6.27□□□□□ -1.41
TY1A-BLQ12266 GTO3YMR251W 1101 nt6.27□□□□□ -1.41
TY1A-BLQ12266 ATX2YOR079C 942 nt6.27□□□□□ -1.41
TY1A-BLQ12266 YPR127WYPR127W 1038 nt6.27□□□□□ -1.41
TY1A-BLQ12266 RIB5YBR256C 717 nt6.27□□□□□ -1.41
TY1A-BLQ12266 GPH1YPR160W 2709 nt6.27□□□□□ -1.41
TY1A-BLQ12266 YJL049WYJL049W 1353 nt6.27□□□□□ -1.41
TY1A-BLQ12266 GSH1YJL101C 2037 nt6.26□□□□□ -1.41
TY1A-BLQ12266 ORC6YHR118C 1308 nt6.26□□□□□ -1.41
TY1A-BLQ12266 PRP24YMR268C 1335 nt6.26□□□□□ -1.41
TY1A-BLQ12266 TDA6YPR157W 1404 nt6.26□□□□□ -1.41
TY1A-BLQ12266 TRM1YDR120C 1713 nt6.26□□□□□ -1.41
TY1A-BLQ12266 ATG31YDR022C 591 nt6.26□□□□□ -1.41
TY1A-BLQ12266 YDR248CYDR248C 582 nt6.26□□□□□ -1.41
TY1A-BLQ12266 DIG2YDR480W 972 nt6.26□□□□□ -1.41
TY1A-BLQ12266 IES5YER092W 378 nt6.26□□□□□ -1.41
TY1A-BLQ12266 RPC37YKR025W 849 nt6.26□□□□□ -1.41
TY1A-BLQ12266 YAF9YNL107W 681 nt6.26□□□□□ -1.41
TY1A-BLQ12266 YMC1YPR058W 924 nt6.26□□□□□ -1.41
TY1A-BLQ12266 SDH8YBR269C 417 nt6.26□□□□□ -1.41
TY1A-BLQ12266 JIP5YPR169W 1479 nt6.26□□□□□ -1.41
TY1A-BLQ12266 HSM3YBR272C 1443 nt6.25□□□□□ -1.41
TY1A-BLQ12266 BSC1YDL037C 987 nt6.25□□□□□ -1.41
TY1A-BLQ12266 YGR018CYGR018C 330 nt6.25□□□□□ -1.41
TY1A-BLQ12266 YHR125WYHR125W 306 nt6.25□□□□□ -1.41
TY1A-BLQ12266 RPL2BYIL018W 765 nt6.25□□□□□ -1.41
TY1A-BLQ12266 YIL177W-AYIL177W-A 483 nt6.25□□□□□ -1.41
TY1A-BLQ12266 YJL225W-AYJL225W-A 483 nt6.25□□□□□ -1.41
TY1A-BLQ12266 ADI1YMR009W 540 nt6.25□□□□□ -1.41
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