Protein–RNA interactions for Protein: Q12208

USB1, U6 snRNA phosphodiesterase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
USB1Q12208 OAZ1YPL052W 879 nt3.82□□□□□ -1.8
USB1Q12208 CDC9YDL164C 2268 nt3.82□□□□□ -1.8
USB1Q12208 RRN11YML043C 1524 nt3.81□□□□□ -1.8
USB1Q12208 FMP30YPL103C 1407 nt3.81□□□□□ -1.8
USB1Q12208 THS1YIL078W 2205 nt3.81□□□□□ -1.8
USB1Q12208 ISR1YPR106W 1332 nt3.81□□□□□ -1.8
USB1Q12208 CIA2YHR122W 696 nt3.81□□□□□ -1.8
USB1Q12208 MHO1YJR008W 1017 nt3.81□□□□□ -1.8
USB1Q12208 YJR012CYJR012C 624 nt3.81□□□□□ -1.8
USB1Q12208 RRT7YLL030C 342 nt3.81□□□□□ -1.8
USB1Q12208 POL12YBL035C 2118 nt3.81□□□□□ -1.8
USB1Q12208 RGS2YOR107W 930 nt3.81□□□□□ -1.8
USB1Q12208 FAA1YOR317W 2103 nt3.81□□□□□ -1.8
USB1Q12208 YPR071WYPR071W 636 nt3.81□□□□□ -1.8
USB1Q12208 YBR196C-BYBR196C-B 105 nt3.81□□□□□ -1.8
USB1Q12208 HOS3YPL116W 2094 nt3.81□□□□□ -1.8
USB1Q12208 CLB4YLR210W 1383 nt3.8□□□□□ -1.8
USB1Q12208 WSS1YHR134W 810 nt3.8□□□□□ -1.8
USB1Q12208 AAD10YJR155W 867 nt3.8□□□□□ -1.8
USB1Q12208 TVP38YKR088C 1014 nt3.8□□□□□ -1.8
USB1Q12208 PML1YLR016C 615 nt3.8□□□□□ -1.8
USB1Q12208 CPR6YLR216C 1116 nt3.8□□□□□ -1.8
USB1Q12208 ECM23YPL021W 564 nt3.8□□□□□ -1.8
USB1Q12208 EGT2YNL327W 3126 nt3.8□□□□□ -1.8
USB1Q12208 IMD2YHR216W 1572 nt3.8□□□□□ -1.8
USB1Q12208 YMR221CYMR221C 1515 nt3.8□□□□□ -1.8
USB1Q12208 MET4YNL103W 2019 nt3.79□□□□□ -1.8
USB1Q12208 YDR445CYDR445C 408 nt3.79□□□□□ -1.8
USB1Q12208 MNN11YJL183W 1269 nt3.79□□□□□ -1.8
USB1Q12208 URE2YNL229C 1065 nt3.79□□□□□ -1.8
USB1Q12208 HEM15YOR176W 1182 nt3.79□□□□□ -1.8
USB1Q12208 SET6YPL165C 1122 nt3.79□□□□□ -1.8
USB1Q12208 BCK2YER167W 2556 nt3.79□□□□□ -1.8
USB1Q12208 PAH1YMR165C 2589 nt3.79□□□□□ -1.8
USB1Q12208 SSH4YKL124W 1740 nt3.78□□□□□ -1.8
USB1Q12208 TMN2YDR107C 2019 nt3.78□□□□□ -1.8
USB1Q12208 LYS5YGL154C 819 nt3.78□□□□□ -1.8
USB1Q12208 FMP48YGR052W 1110 nt3.78□□□□□ -1.8
USB1Q12208 LNP1YHR192W 837 nt3.78□□□□□ -1.8
USB1Q12208 REI1YBR267W 1182 nt3.78□□□□□ -1.8
USB1Q12208 KAP114YGL241W 3015 nt3.78□□□□□ -1.8
USB1Q12208 YER077CYER077C 2067 nt3.77□□□□□ -1.81
USB1Q12208 YGR011WYGR011W 327 nt3.77□□□□□ -1.81
USB1Q12208 YIL014C-AYIL014C-A 315 nt3.77□□□□□ -1.81
USB1Q12208 YIL163CYIL163C 354 nt3.77□□□□□ -1.81
USB1Q12208 FBP1YLR377C 1047 nt3.77□□□□□ -1.81
USB1Q12208 TCO89YPL180W 2400 nt3.77□□□□□ -1.81
USB1Q12208 YEH2YLR020C 1617 nt3.77□□□□□ -1.81
USB1Q12208 FDC1YDR539W 1512 nt3.76□□□□□ -1.81
USB1Q12208 DPH6YLR143W 2058 nt3.76□□□□□ -1.81
USB1Q12208 GAS5YOL030W 1455 nt3.76□□□□□ -1.81
USB1Q12208 RPL8AYHL033C 771 nt3.76□□□□□ -1.81
USB1Q12208 YIL021C-AYIL021C-A 270 nt3.76□□□□□ -1.81
USB1Q12208 MAP1YLR244C 1164 nt3.76□□□□□ -1.81
USB1Q12208 RPC19YNL113W 429 nt3.76□□□□□ -1.81
USB1Q12208 YOR342CYOR342C 960 nt3.76□□□□□ -1.81
USB1Q12208 ICY2YPL250C 411 nt3.76□□□□□ -1.81
USB1Q12208 YBR219CYBR219C 384 nt3.76□□□□□ -1.81
USB1Q12208 SAS10YDL153C 1833 nt3.76□□□□□ -1.81
USB1Q12208 VBA2YBR293W 1425 nt3.76□□□□□ -1.81
USB1Q12208 YMR111CYMR111C 1389 nt3.76□□□□□ -1.81
USB1Q12208 CDC6YJL194W 1542 nt3.75□□□□□ -1.81
USB1Q12208 SKG1YKR100C 1068 nt3.75□□□□□ -1.81
USB1Q12208 YLR364C-AYLR364C-A 123 nt3.75□□□□□ -1.81
USB1Q12208 YMR315WYMR315W 1050 nt3.75□□□□□ -1.81
USB1Q12208 PCL1YNL289W 840 nt3.75□□□□□ -1.81
USB1Q12208 PRD1YCL057W 2139 nt3.74□□□□□ -1.81
USB1Q12208 ALR2YFL050C 2577 nt3.74□□□□□ -1.81
USB1Q12208 MDL1YLR188W 2088 nt3.74□□□□□ -1.81
USB1Q12208 NAM2YLR382C 2685 nt3.74□□□□□ -1.81
USB1Q12208 STV1YMR054W 2673 nt3.74□□□□□ -1.81
USB1Q12208 RPO21YDL140C 5202 nt3.74□□□□□ -1.81
USB1Q12208 COS4YFL062W 1140 nt3.74□□□□□ -1.81
USB1Q12208 DBR1YKL149C 1218 nt3.74□□□□□ -1.81
USB1Q12208 RPS0BYLR048W 759 nt3.74□□□□□ -1.81
USB1Q12208 COS3YML132W 1140 nt3.74□□□□□ -1.81
USB1Q12208 MTR10YOR160W 2919 nt3.74□□□□□ -1.81
USB1Q12208 YDC1YPL087W 954 nt3.74□□□□□ -1.81
USB1Q12208 SPO19YPL130W 672 nt3.74□□□□□ -1.81
USB1Q12208 COS2YBR302C 1140 nt3.74□□□□□ -1.81
USB1Q12208 CYM1YDR430C 2970 nt3.74□□□□□ -1.81
USB1Q12208 SUL2YLR092W 2682 nt3.74□□□□□ -1.81
USB1Q12208 PEP5YMR231W 3090 nt3.74□□□□□ -1.81
USB1Q12208 WTM1YOR230W 1314 nt3.73□□□□□ -1.81
USB1Q12208 MNN4YKL201C 3537 nt3.73□□□□□ -1.81
USB1Q12208 YLR152CYLR152C 1731 nt3.73□□□□□ -1.81
USB1Q12208 DAS2YDR020C 699 nt3.73□□□□□ -1.81
USB1Q12208 BUD13YGL174W 801 nt3.73□□□□□ -1.81
USB1Q12208 YLR036CYLR036C 612 nt3.73□□□□□ -1.81
USB1Q12208 CDC42YLR229C 576 nt3.73□□□□□ -1.81
USB1Q12208 SWC7YLR385C 399 nt3.73□□□□□ -1.81
USB1Q12208 YNL057WYNL057W 333 nt3.73□□□□□ -1.81
USB1Q12208 SPS19YNL202W 879 nt3.73□□□□□ -1.81
USB1Q12208 UBP6YFR010W 1500 nt3.73□□□□□ -1.81
USB1Q12208 RAD57YDR004W 1383 nt3.73□□□□□ -1.81
USB1Q12208 HSP82YPL240C 2130 nt3.73□□□□□ -1.81
USB1Q12208 SRS2YJL092W 3525 nt3.73□□□□□ -1.81
USB1Q12208 NUG1YER006W 1563 nt3.72□□□□□ -1.81
USB1Q12208 RAD52YML032C 1416 nt3.72□□□□□ -1.81
USB1Q12208 YIL001WYIL001W 1542 nt3.72□□□□□ -1.81
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