Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC173Q0VFZ6 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC173Q0VFZ6 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC173Q0VFZ6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC173Q0VFZ6 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC173Q0VFZ6 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC173Q0VFZ6 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC173Q0VFZ6 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC173Q0VFZ6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC173Q0VFZ6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC173Q0VFZ6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC173Q0VFZ6 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC173Q0VFZ6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC173Q0VFZ6 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC173Q0VFZ6 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC173Q0VFZ6 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC173Q0VFZ6 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC173Q0VFZ6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC173Q0VFZ6 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC173Q0VFZ6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC173Q0VFZ6 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC173Q0VFZ6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC173Q0VFZ6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC173Q0VFZ6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC173Q0VFZ6 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC173Q0VFZ6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC173Q0VFZ6 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC173Q0VFZ6 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC173Q0VFZ6 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC173Q0VFZ6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC173Q0VFZ6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC173Q0VFZ6 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC173Q0VFZ6 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC173Q0VFZ6 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC173Q0VFZ6 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC173Q0VFZ6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC173Q0VFZ6 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC173Q0VFZ6 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC173Q0VFZ6 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC173Q0VFZ6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC173Q0VFZ6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC173Q0VFZ6 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC173Q0VFZ6 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC173Q0VFZ6 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC173Q0VFZ6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC173Q0VFZ6 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC173Q0VFZ6 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC173Q0VFZ6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC173Q0VFZ6 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC173Q0VFZ6 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC173Q0VFZ6 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC173Q0VFZ6 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC173Q0VFZ6 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC173Q0VFZ6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC173Q0VFZ6 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC173Q0VFZ6 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC173Q0VFZ6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC173Q0VFZ6 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC173Q0VFZ6 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC173Q0VFZ6 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC173Q0VFZ6 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC173Q0VFZ6 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC173Q0VFZ6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC173Q0VFZ6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC173Q0VFZ6 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC173Q0VFZ6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC173Q0VFZ6 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC173Q0VFZ6 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC173Q0VFZ6 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC173Q0VFZ6 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC173Q0VFZ6 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCDC173Q0VFZ6 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC173Q0VFZ6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC173Q0VFZ6 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC173Q0VFZ6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC173Q0VFZ6 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC173Q0VFZ6 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC173Q0VFZ6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC173Q0VFZ6 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC173Q0VFZ6 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC173Q0VFZ6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC173Q0VFZ6 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC173Q0VFZ6 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC173Q0VFZ6 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC173Q0VFZ6 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC173Q0VFZ6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC173Q0VFZ6 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC173Q0VFZ6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC173Q0VFZ6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC173Q0VFZ6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC173Q0VFZ6 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC173Q0VFZ6 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC173Q0VFZ6 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC173Q0VFZ6 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC173Q0VFZ6 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC173Q0VFZ6 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC173Q0VFZ6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC173Q0VFZ6 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC173Q0VFZ6 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC173Q0VFZ6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms