Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI6

SLC38A11, Putative sodium-coupled neutral amino acid transporter 11, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A11Q08AI6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC38A11Q08AI6 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC38A11Q08AI6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC38A11Q08AI6 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC38A11Q08AI6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC38A11Q08AI6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC38A11Q08AI6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC38A11Q08AI6 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC38A11Q08AI6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC38A11Q08AI6 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC38A11Q08AI6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC38A11Q08AI6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC38A11Q08AI6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC38A11Q08AI6 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC38A11Q08AI6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC38A11Q08AI6 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC38A11Q08AI6 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC38A11Q08AI6 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC38A11Q08AI6 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC38A11Q08AI6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC38A11Q08AI6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC38A11Q08AI6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC38A11Q08AI6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC38A11Q08AI6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC38A11Q08AI6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC38A11Q08AI6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC38A11Q08AI6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC38A11Q08AI6 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC38A11Q08AI6 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC38A11Q08AI6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC38A11Q08AI6 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC38A11Q08AI6 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC38A11Q08AI6 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC38A11Q08AI6 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC38A11Q08AI6 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC38A11Q08AI6 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC38A11Q08AI6 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC38A11Q08AI6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC38A11Q08AI6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC38A11Q08AI6 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC38A11Q08AI6 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC38A11Q08AI6 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC38A11Q08AI6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC38A11Q08AI6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC38A11Q08AI6 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC38A11Q08AI6 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC38A11Q08AI6 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC38A11Q08AI6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC38A11Q08AI6 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC38A11Q08AI6 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC38A11Q08AI6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC38A11Q08AI6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC38A11Q08AI6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC38A11Q08AI6 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC38A11Q08AI6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC38A11Q08AI6 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC38A11Q08AI6 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC38A11Q08AI6 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC38A11Q08AI6 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC38A11Q08AI6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC38A11Q08AI6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC38A11Q08AI6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC38A11Q08AI6 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC38A11Q08AI6 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC38A11Q08AI6 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC38A11Q08AI6 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC38A11Q08AI6 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC38A11Q08AI6 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC38A11Q08AI6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC38A11Q08AI6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC38A11Q08AI6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC38A11Q08AI6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC38A11Q08AI6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC38A11Q08AI6 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC38A11Q08AI6 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC38A11Q08AI6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC38A11Q08AI6 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC38A11Q08AI6 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC38A11Q08AI6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC38A11Q08AI6 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC38A11Q08AI6 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC38A11Q08AI6 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC38A11Q08AI6 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC38A11Q08AI6 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC38A11Q08AI6 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC38A11Q08AI6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC38A11Q08AI6 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC38A11Q08AI6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC38A11Q08AI6 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC38A11Q08AI6 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC38A11Q08AI6 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SLC38A11Q08AI6 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SLC38A11Q08AI6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
SLC38A11Q08AI6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC38A11Q08AI6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC38A11Q08AI6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC38A11Q08AI6 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC38A11Q08AI6 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC38A11Q08AI6 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC38A11Q08AI6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms