Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SLFN5Q08AF3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SLFN5Q08AF3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SLFN5Q08AF3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SLFN5Q08AF3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SLFN5Q08AF3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SLFN5Q08AF3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SLFN5Q08AF3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SLFN5Q08AF3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SLFN5Q08AF3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SLFN5Q08AF3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SLFN5Q08AF3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SLFN5Q08AF3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SLFN5Q08AF3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SLFN5Q08AF3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
SLFN5Q08AF3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
SLFN5Q08AF3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
SLFN5Q08AF3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
SLFN5Q08AF3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SLFN5Q08AF3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SLFN5Q08AF3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SLFN5Q08AF3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SLFN5Q08AF3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SLFN5Q08AF3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SLFN5Q08AF3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.27
SLFN5Q08AF3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SLFN5Q08AF3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SLFN5Q08AF3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SLFN5Q08AF3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SLFN5Q08AF3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SLFN5Q08AF3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SLFN5Q08AF3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SLFN5Q08AF3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SLFN5Q08AF3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SLFN5Q08AF3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SLFN5Q08AF3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SLFN5Q08AF3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
SLFN5Q08AF3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SLFN5Q08AF3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SLFN5Q08AF3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SLFN5Q08AF3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SLFN5Q08AF3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SLFN5Q08AF3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SLFN5Q08AF3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SLFN5Q08AF3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SLFN5Q08AF3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SLFN5Q08AF3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SLFN5Q08AF3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SLFN5Q08AF3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SLFN5Q08AF3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SLFN5Q08AF3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SLFN5Q08AF3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SLFN5Q08AF3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SLFN5Q08AF3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SLFN5Q08AF3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SLFN5Q08AF3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SLFN5Q08AF3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
SLFN5Q08AF3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SLFN5Q08AF3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SLFN5Q08AF3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SLFN5Q08AF3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SLFN5Q08AF3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SLFN5Q08AF3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SLFN5Q08AF3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SLFN5Q08AF3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SLFN5Q08AF3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SLFN5Q08AF3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SLFN5Q08AF3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SLFN5Q08AF3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
SLFN5Q08AF3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SLFN5Q08AF3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SLFN5Q08AF3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SLFN5Q08AF3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SLFN5Q08AF3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SLFN5Q08AF3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SLFN5Q08AF3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SLFN5Q08AF3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SLFN5Q08AF3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SLFN5Q08AF3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SLFN5Q08AF3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SLFN5Q08AF3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SLFN5Q08AF3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SLFN5Q08AF3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SLFN5Q08AF3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
SLFN5Q08AF3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SLFN5Q08AF3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SLFN5Q08AF3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SLFN5Q08AF3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SLFN5Q08AF3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SLFN5Q08AF3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
SLFN5Q08AF3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SLFN5Q08AF3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SLFN5Q08AF3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SLFN5Q08AF3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SLFN5Q08AF3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SLFN5Q08AF3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SLFN5Q08AF3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SLFN5Q08AF3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SLFN5Q08AF3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SLFN5Q08AF3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms