Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SSRP1Q08945 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SSRP1Q08945 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SSRP1Q08945 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SSRP1Q08945 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SSRP1Q08945 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SSRP1Q08945 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SSRP1Q08945 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SSRP1Q08945 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SSRP1Q08945 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SSRP1Q08945 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SSRP1Q08945 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SSRP1Q08945 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SSRP1Q08945 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SSRP1Q08945 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SSRP1Q08945 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
SSRP1Q08945 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SSRP1Q08945 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SSRP1Q08945 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SSRP1Q08945 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SSRP1Q08945 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SSRP1Q08945 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SSRP1Q08945 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SSRP1Q08945 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SSRP1Q08945 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SSRP1Q08945 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SSRP1Q08945 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SSRP1Q08945 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SSRP1Q08945 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SSRP1Q08945 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SSRP1Q08945 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SSRP1Q08945 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SSRP1Q08945 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SSRP1Q08945 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SSRP1Q08945 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SSRP1Q08945 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SSRP1Q08945 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SSRP1Q08945 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SSRP1Q08945 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SSRP1Q08945 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SSRP1Q08945 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SSRP1Q08945 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SSRP1Q08945 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SSRP1Q08945 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SSRP1Q08945 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SSRP1Q08945 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SSRP1Q08945 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SSRP1Q08945 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SSRP1Q08945 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SSRP1Q08945 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SSRP1Q08945 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SSRP1Q08945 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SSRP1Q08945 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SSRP1Q08945 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SSRP1Q08945 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SSRP1Q08945 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SSRP1Q08945 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SSRP1Q08945 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SSRP1Q08945 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SSRP1Q08945 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SSRP1Q08945 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SSRP1Q08945 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SSRP1Q08945 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SSRP1Q08945 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SSRP1Q08945 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SSRP1Q08945 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SSRP1Q08945 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SSRP1Q08945 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SSRP1Q08945 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SSRP1Q08945 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SSRP1Q08945 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SSRP1Q08945 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SSRP1Q08945 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SSRP1Q08945 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SSRP1Q08945 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SSRP1Q08945 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SSRP1Q08945 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SSRP1Q08945 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SSRP1Q08945 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SSRP1Q08945 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SSRP1Q08945 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SSRP1Q08945 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SSRP1Q08945 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SSRP1Q08945 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SSRP1Q08945 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SSRP1Q08945 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SSRP1Q08945 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SSRP1Q08945 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SSRP1Q08945 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SSRP1Q08945 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SSRP1Q08945 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SSRP1Q08945 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SSRP1Q08945 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SSRP1Q08945 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SSRP1Q08945 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SSRP1Q08945 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SSRP1Q08945 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SSRP1Q08945 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SSRP1Q08945 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SSRP1Q08945 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms