Protein–RNA interactions for Protein: Q08211

DHX9, ATP-dependent RNA helicase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX9Q08211 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DHX9Q08211 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DHX9Q08211 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DHX9Q08211 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DHX9Q08211 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DHX9Q08211 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
DHX9Q08211 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
DHX9Q08211 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DHX9Q08211 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DHX9Q08211 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DHX9Q08211 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DHX9Q08211 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DHX9Q08211 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DHX9Q08211 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DHX9Q08211 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DHX9Q08211 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DHX9Q08211 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DHX9Q08211 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DHX9Q08211 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DHX9Q08211 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DHX9Q08211 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DHX9Q08211 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DHX9Q08211 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DHX9Q08211 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DHX9Q08211 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
DHX9Q08211 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DHX9Q08211 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DHX9Q08211 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DHX9Q08211 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DHX9Q08211 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DHX9Q08211 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DHX9Q08211 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DHX9Q08211 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DHX9Q08211 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DHX9Q08211 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DHX9Q08211 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DHX9Q08211 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DHX9Q08211 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DHX9Q08211 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DHX9Q08211 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DHX9Q08211 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DHX9Q08211 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DHX9Q08211 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DHX9Q08211 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DHX9Q08211 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DHX9Q08211 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DHX9Q08211 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DHX9Q08211 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DHX9Q08211 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DHX9Q08211 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DHX9Q08211 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DHX9Q08211 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DHX9Q08211 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DHX9Q08211 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
DHX9Q08211 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DHX9Q08211 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DHX9Q08211 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DHX9Q08211 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DHX9Q08211 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DHX9Q08211 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DHX9Q08211 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
DHX9Q08211 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DHX9Q08211 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DHX9Q08211 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DHX9Q08211 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DHX9Q08211 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DHX9Q08211 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DHX9Q08211 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DHX9Q08211 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
DHX9Q08211 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DHX9Q08211 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
DHX9Q08211 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DHX9Q08211 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DHX9Q08211 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DHX9Q08211 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DHX9Q08211 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DHX9Q08211 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DHX9Q08211 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DHX9Q08211 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DHX9Q08211 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DHX9Q08211 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DHX9Q08211 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DHX9Q08211 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DHX9Q08211 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DHX9Q08211 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DHX9Q08211 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DHX9Q08211 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DHX9Q08211 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DHX9Q08211 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
DHX9Q08211 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DHX9Q08211 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DHX9Q08211 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
DHX9Q08211 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DHX9Q08211 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
DHX9Q08211 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DHX9Q08211 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DHX9Q08211 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DHX9Q08211 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DHX9Q08211 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DHX9Q08211 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.8 ms