Protein–RNA interactions for Protein: Q08209

PPP3CA, Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP3CAQ08209 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPP3CAQ08209 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPP3CAQ08209 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPP3CAQ08209 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPP3CAQ08209 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPP3CAQ08209 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPP3CAQ08209 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PPP3CAQ08209 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPP3CAQ08209 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPP3CAQ08209 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPP3CAQ08209 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPP3CAQ08209 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPP3CAQ08209 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPP3CAQ08209 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPP3CAQ08209 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPP3CAQ08209 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPP3CAQ08209 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPP3CAQ08209 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPP3CAQ08209 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPP3CAQ08209 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPP3CAQ08209 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPP3CAQ08209 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPP3CAQ08209 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPP3CAQ08209 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPP3CAQ08209 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPP3CAQ08209 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPP3CAQ08209 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPP3CAQ08209 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PPP3CAQ08209 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP3CAQ08209 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP3CAQ08209 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP3CAQ08209 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP3CAQ08209 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP3CAQ08209 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP3CAQ08209 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPP3CAQ08209 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPP3CAQ08209 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPP3CAQ08209 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PPP3CAQ08209 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPP3CAQ08209 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPP3CAQ08209 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPP3CAQ08209 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPP3CAQ08209 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPP3CAQ08209 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPP3CAQ08209 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPP3CAQ08209 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPP3CAQ08209 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPP3CAQ08209 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPP3CAQ08209 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PPP3CAQ08209 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPP3CAQ08209 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPP3CAQ08209 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPP3CAQ08209 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPP3CAQ08209 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPP3CAQ08209 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPP3CAQ08209 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPP3CAQ08209 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPP3CAQ08209 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPP3CAQ08209 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPP3CAQ08209 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPP3CAQ08209 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPP3CAQ08209 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPP3CAQ08209 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPP3CAQ08209 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPP3CAQ08209 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPP3CAQ08209 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPP3CAQ08209 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPP3CAQ08209 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPP3CAQ08209 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PPP3CAQ08209 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PPP3CAQ08209 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPP3CAQ08209 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPP3CAQ08209 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPP3CAQ08209 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPP3CAQ08209 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPP3CAQ08209 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PPP3CAQ08209 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPP3CAQ08209 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPP3CAQ08209 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPP3CAQ08209 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPP3CAQ08209 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPP3CAQ08209 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPP3CAQ08209 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPP3CAQ08209 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PPP3CAQ08209 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPP3CAQ08209 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PPP3CAQ08209 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPP3CAQ08209 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPP3CAQ08209 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPP3CAQ08209 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPP3CAQ08209 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPP3CAQ08209 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPP3CAQ08209 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPP3CAQ08209 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPP3CAQ08209 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPP3CAQ08209 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPP3CAQ08209 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPP3CAQ08209 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPP3CAQ08209 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPP3CAQ08209 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms