Protein–RNA interactions for Protein: Q07869

PPARA, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARAQ07869 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PPARAQ07869 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PPARAQ07869 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PPARAQ07869 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PPARAQ07869 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PPARAQ07869 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PPARAQ07869 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PPARAQ07869 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PPARAQ07869 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PPARAQ07869 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PPARAQ07869 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PPARAQ07869 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PPARAQ07869 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
PPARAQ07869 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PPARAQ07869 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PPARAQ07869 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PPARAQ07869 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PPARAQ07869 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PPARAQ07869 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PPARAQ07869 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PPARAQ07869 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PPARAQ07869 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PPARAQ07869 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PPARAQ07869 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PPARAQ07869 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PPARAQ07869 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PPARAQ07869 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PPARAQ07869 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PPARAQ07869 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PPARAQ07869 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PPARAQ07869 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PPARAQ07869 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PPARAQ07869 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PPARAQ07869 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PPARAQ07869 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PPARAQ07869 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PPARAQ07869 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PPARAQ07869 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PPARAQ07869 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PPARAQ07869 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PPARAQ07869 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PPARAQ07869 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PPARAQ07869 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PPARAQ07869 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PPARAQ07869 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PPARAQ07869 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PPARAQ07869 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PPARAQ07869 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PPARAQ07869 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PPARAQ07869 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PPARAQ07869 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PPARAQ07869 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PPARAQ07869 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PPARAQ07869 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PPARAQ07869 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PPARAQ07869 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PPARAQ07869 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PPARAQ07869 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PPARAQ07869 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PPARAQ07869 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PPARAQ07869 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PPARAQ07869 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PPARAQ07869 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PPARAQ07869 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PPARAQ07869 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PPARAQ07869 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
PPARAQ07869 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
PPARAQ07869 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
PPARAQ07869 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PPARAQ07869 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PPARAQ07869 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PPARAQ07869 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PPARAQ07869 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PPARAQ07869 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PPARAQ07869 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PPARAQ07869 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PPARAQ07869 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PPARAQ07869 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PPARAQ07869 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
PPARAQ07869 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PPARAQ07869 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PPARAQ07869 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PPARAQ07869 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PPARAQ07869 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PPARAQ07869 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PPARAQ07869 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PPARAQ07869 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PPARAQ07869 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PPARAQ07869 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PPARAQ07869 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PPARAQ07869 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PPARAQ07869 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PPARAQ07869 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PPARAQ07869 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PPARAQ07869 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PPARAQ07869 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PPARAQ07869 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PPARAQ07869 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PPARAQ07869 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PPARAQ07869 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms