Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLEQ07864 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
POLEQ07864 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLEQ07864 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLEQ07864 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLEQ07864 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLEQ07864 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLEQ07864 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLEQ07864 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLEQ07864 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLEQ07864 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLEQ07864 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLEQ07864 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLEQ07864 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLEQ07864 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLEQ07864 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLEQ07864 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLEQ07864 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLEQ07864 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
POLEQ07864 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
POLEQ07864 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
POLEQ07864 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
POLEQ07864 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
POLEQ07864 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
POLEQ07864 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
POLEQ07864 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
POLEQ07864 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
POLEQ07864 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
POLEQ07864 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
POLEQ07864 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
POLEQ07864 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
POLEQ07864 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLEQ07864 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLEQ07864 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLEQ07864 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLEQ07864 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
POLEQ07864 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLEQ07864 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLEQ07864 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLEQ07864 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLEQ07864 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
POLEQ07864 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLEQ07864 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLEQ07864 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
POLEQ07864 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
POLEQ07864 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
POLEQ07864 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20■□□□□ 0.79
POLEQ07864 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
POLEQ07864 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
POLEQ07864 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20■□□□□ 0.79
POLEQ07864 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
POLEQ07864 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20■□□□□ 0.79
POLEQ07864 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
POLEQ07864 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
POLEQ07864 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
POLEQ07864 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLEQ07864 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
POLEQ07864 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLEQ07864 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLEQ07864 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLEQ07864 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLEQ07864 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLEQ07864 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLEQ07864 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLEQ07864 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
POLEQ07864 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLEQ07864 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLEQ07864 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLEQ07864 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLEQ07864 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLEQ07864 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLEQ07864 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLEQ07864 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLEQ07864 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLEQ07864 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLEQ07864 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLEQ07864 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLEQ07864 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLEQ07864 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLEQ07864 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLEQ07864 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLEQ07864 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLEQ07864 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLEQ07864 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLEQ07864 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
POLEQ07864 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLEQ07864 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLEQ07864 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLEQ07864 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLEQ07864 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLEQ07864 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLEQ07864 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLEQ07864 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLEQ07864 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLEQ07864 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLEQ07864 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLEQ07864 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLEQ07864 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLEQ07864 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLEQ07864 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms