Protein–RNA interactions for Protein: Q07699

SCN1B, Sodium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1BQ07699 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCN1BQ07699 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCN1BQ07699 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCN1BQ07699 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCN1BQ07699 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCN1BQ07699 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCN1BQ07699 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCN1BQ07699 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCN1BQ07699 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCN1BQ07699 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCN1BQ07699 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SCN1BQ07699 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SCN1BQ07699 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SCN1BQ07699 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SCN1BQ07699 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SCN1BQ07699 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SCN1BQ07699 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SCN1BQ07699 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SCN1BQ07699 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SCN1BQ07699 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SCN1BQ07699 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SCN1BQ07699 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SCN1BQ07699 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SCN1BQ07699 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SCN1BQ07699 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SCN1BQ07699 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SCN1BQ07699 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SCN1BQ07699 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SCN1BQ07699 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SCN1BQ07699 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SCN1BQ07699 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SCN1BQ07699 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SCN1BQ07699 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SCN1BQ07699 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SCN1BQ07699 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SCN1BQ07699 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SCN1BQ07699 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SCN1BQ07699 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SCN1BQ07699 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SCN1BQ07699 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SCN1BQ07699 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SCN1BQ07699 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SCN1BQ07699 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SCN1BQ07699 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SCN1BQ07699 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SCN1BQ07699 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SCN1BQ07699 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SCN1BQ07699 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SCN1BQ07699 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SCN1BQ07699 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SCN1BQ07699 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SCN1BQ07699 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SCN1BQ07699 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SCN1BQ07699 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SCN1BQ07699 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SCN1BQ07699 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SCN1BQ07699 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
SCN1BQ07699 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
SCN1BQ07699 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SCN1BQ07699 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SCN1BQ07699 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SCN1BQ07699 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SCN1BQ07699 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SCN1BQ07699 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SCN1BQ07699 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SCN1BQ07699 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SCN1BQ07699 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SCN1BQ07699 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SCN1BQ07699 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SCN1BQ07699 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SCN1BQ07699 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SCN1BQ07699 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SCN1BQ07699 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SCN1BQ07699 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SCN1BQ07699 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SCN1BQ07699 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SCN1BQ07699 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SCN1BQ07699 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SCN1BQ07699 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SCN1BQ07699 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SCN1BQ07699 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SCN1BQ07699 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SCN1BQ07699 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
SCN1BQ07699 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
SCN1BQ07699 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SCN1BQ07699 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SCN1BQ07699 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SCN1BQ07699 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SCN1BQ07699 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SCN1BQ07699 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SCN1BQ07699 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SCN1BQ07699 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SCN1BQ07699 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SCN1BQ07699 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SCN1BQ07699 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SCN1BQ07699 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SCN1BQ07699 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SCN1BQ07699 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
SCN1BQ07699 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SCN1BQ07699 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms