Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC18A2Q05940 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC18A2Q05940 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC18A2Q05940 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC18A2Q05940 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC18A2Q05940 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC18A2Q05940 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC18A2Q05940 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC18A2Q05940 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC18A2Q05940 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC18A2Q05940 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC18A2Q05940 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC18A2Q05940 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC18A2Q05940 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC18A2Q05940 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC18A2Q05940 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC18A2Q05940 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC18A2Q05940 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC18A2Q05940 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC18A2Q05940 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC18A2Q05940 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC18A2Q05940 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC18A2Q05940 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC18A2Q05940 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC18A2Q05940 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC18A2Q05940 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC18A2Q05940 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC18A2Q05940 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC18A2Q05940 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC18A2Q05940 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC18A2Q05940 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC18A2Q05940 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC18A2Q05940 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC18A2Q05940 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC18A2Q05940 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC18A2Q05940 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC18A2Q05940 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC18A2Q05940 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC18A2Q05940 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC18A2Q05940 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC18A2Q05940 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC18A2Q05940 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC18A2Q05940 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC18A2Q05940 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC18A2Q05940 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SLC18A2Q05940 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC18A2Q05940 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC18A2Q05940 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC18A2Q05940 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC18A2Q05940 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC18A2Q05940 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC18A2Q05940 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC18A2Q05940 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC18A2Q05940 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC18A2Q05940 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC18A2Q05940 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC18A2Q05940 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC18A2Q05940 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC18A2Q05940 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC18A2Q05940 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC18A2Q05940 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC18A2Q05940 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC18A2Q05940 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC18A2Q05940 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC18A2Q05940 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC18A2Q05940 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC18A2Q05940 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC18A2Q05940 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC18A2Q05940 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC18A2Q05940 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC18A2Q05940 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC18A2Q05940 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC18A2Q05940 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC18A2Q05940 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC18A2Q05940 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC18A2Q05940 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC18A2Q05940 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC18A2Q05940 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC18A2Q05940 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC18A2Q05940 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC18A2Q05940 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC18A2Q05940 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC18A2Q05940 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC18A2Q05940 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC18A2Q05940 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC18A2Q05940 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC18A2Q05940 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC18A2Q05940 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC18A2Q05940 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC18A2Q05940 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC18A2Q05940 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC18A2Q05940 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC18A2Q05940 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC18A2Q05940 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC18A2Q05940 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC18A2Q05940 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC18A2Q05940 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC18A2Q05940 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC18A2Q05940 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC18A2Q05940 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms