Protein–RNA interactions for Protein: Q05066

SRY, Sex-determining region Y protein, humanhuman

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRYQ05066 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SRYQ05066 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SRYQ05066 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SRYQ05066 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRYQ05066 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRYQ05066 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRYQ05066 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRYQ05066 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRYQ05066 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRYQ05066 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SRYQ05066 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRYQ05066 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRYQ05066 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRYQ05066 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRYQ05066 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRYQ05066 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRYQ05066 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SRYQ05066 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRYQ05066 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRYQ05066 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SRYQ05066 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRYQ05066 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRYQ05066 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRYQ05066 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRYQ05066 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRYQ05066 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRYQ05066 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRYQ05066 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRYQ05066 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRYQ05066 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRYQ05066 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SRYQ05066 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRYQ05066 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRYQ05066 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRYQ05066 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRYQ05066 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRYQ05066 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRYQ05066 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRYQ05066 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRYQ05066 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRYQ05066 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRYQ05066 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SRYQ05066 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRYQ05066 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRYQ05066 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRYQ05066 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRYQ05066 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRYQ05066 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRYQ05066 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRYQ05066 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRYQ05066 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRYQ05066 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SRYQ05066 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SRYQ05066 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SRYQ05066 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRYQ05066 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRYQ05066 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRYQ05066 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRYQ05066 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRYQ05066 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRYQ05066 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRYQ05066 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRYQ05066 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRYQ05066 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRYQ05066 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRYQ05066 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRYQ05066 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRYQ05066 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRYQ05066 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRYQ05066 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRYQ05066 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRYQ05066 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRYQ05066 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRYQ05066 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRYQ05066 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SRYQ05066 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SRYQ05066 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRYQ05066 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRYQ05066 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRYQ05066 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRYQ05066 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRYQ05066 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRYQ05066 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SRYQ05066 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRYQ05066 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRYQ05066 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SRYQ05066 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRYQ05066 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRYQ05066 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRYQ05066 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRYQ05066 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRYQ05066 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SRYQ05066 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRYQ05066 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRYQ05066 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRYQ05066 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRYQ05066 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRYQ05066 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRYQ05066 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRYQ05066 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77 ms