Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SSBP1Q04837 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SSBP1Q04837 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSBP1Q04837 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSBP1Q04837 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSBP1Q04837 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSBP1Q04837 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSBP1Q04837 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSBP1Q04837 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSBP1Q04837 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSBP1Q04837 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSBP1Q04837 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSBP1Q04837 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSBP1Q04837 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSBP1Q04837 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSBP1Q04837 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSBP1Q04837 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SSBP1Q04837 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSBP1Q04837 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSBP1Q04837 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSBP1Q04837 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSBP1Q04837 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSBP1Q04837 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSBP1Q04837 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSBP1Q04837 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSBP1Q04837 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSBP1Q04837 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSBP1Q04837 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSBP1Q04837 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSBP1Q04837 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSBP1Q04837 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSBP1Q04837 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSBP1Q04837 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSBP1Q04837 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSBP1Q04837 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SSBP1Q04837 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSBP1Q04837 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSBP1Q04837 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSBP1Q04837 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSBP1Q04837 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSBP1Q04837 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSBP1Q04837 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSBP1Q04837 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSBP1Q04837 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSBP1Q04837 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSBP1Q04837 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSBP1Q04837 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSBP1Q04837 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSBP1Q04837 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSBP1Q04837 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSBP1Q04837 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSBP1Q04837 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSBP1Q04837 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSBP1Q04837 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSBP1Q04837 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSBP1Q04837 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSBP1Q04837 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSBP1Q04837 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSBP1Q04837 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSBP1Q04837 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSBP1Q04837 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSBP1Q04837 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSBP1Q04837 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSBP1Q04837 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSBP1Q04837 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSBP1Q04837 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSBP1Q04837 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSBP1Q04837 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSBP1Q04837 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSBP1Q04837 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSBP1Q04837 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSBP1Q04837 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSBP1Q04837 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSBP1Q04837 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSBP1Q04837 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSBP1Q04837 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSBP1Q04837 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSBP1Q04837 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSBP1Q04837 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSBP1Q04837 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSBP1Q04837 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSBP1Q04837 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSBP1Q04837 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSBP1Q04837 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSBP1Q04837 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSBP1Q04837 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSBP1Q04837 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSBP1Q04837 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSBP1Q04837 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSBP1Q04837 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSBP1Q04837 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SSBP1Q04837 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SSBP1Q04837 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SSBP1Q04837 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SSBP1Q04837 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SSBP1Q04837 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SSBP1Q04837 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SSBP1Q04837 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SSBP1Q04837 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SSBP1Q04837 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms