Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GCNT1Q02742 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GCNT1Q02742 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GCNT1Q02742 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GCNT1Q02742 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GCNT1Q02742 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
GCNT1Q02742 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GCNT1Q02742 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
GCNT1Q02742 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GCNT1Q02742 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GCNT1Q02742 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24■■□□□ 1.43
GCNT1Q02742 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GCNT1Q02742 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GCNT1Q02742 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GCNT1Q02742 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
GCNT1Q02742 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GCNT1Q02742 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GCNT1Q02742 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GCNT1Q02742 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GCNT1Q02742 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GCNT1Q02742 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GCNT1Q02742 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GCNT1Q02742 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GCNT1Q02742 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GCNT1Q02742 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GCNT1Q02742 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GCNT1Q02742 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GCNT1Q02742 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GCNT1Q02742 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GCNT1Q02742 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GCNT1Q02742 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GCNT1Q02742 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GCNT1Q02742 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GCNT1Q02742 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GCNT1Q02742 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GCNT1Q02742 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GCNT1Q02742 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GCNT1Q02742 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GCNT1Q02742 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GCNT1Q02742 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
GCNT1Q02742 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GCNT1Q02742 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
GCNT1Q02742 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GCNT1Q02742 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GCNT1Q02742 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GCNT1Q02742 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
GCNT1Q02742 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GCNT1Q02742 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GCNT1Q02742 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GCNT1Q02742 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GCNT1Q02742 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GCNT1Q02742 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GCNT1Q02742 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GCNT1Q02742 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GCNT1Q02742 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GCNT1Q02742 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GCNT1Q02742 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GCNT1Q02742 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
GCNT1Q02742 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
GCNT1Q02742 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GCNT1Q02742 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GCNT1Q02742 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GCNT1Q02742 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GCNT1Q02742 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GCNT1Q02742 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
GCNT1Q02742 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GCNT1Q02742 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GCNT1Q02742 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GCNT1Q02742 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GCNT1Q02742 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GCNT1Q02742 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GCNT1Q02742 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GCNT1Q02742 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GCNT1Q02742 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GCNT1Q02742 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GCNT1Q02742 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GCNT1Q02742 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GCNT1Q02742 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GCNT1Q02742 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GCNT1Q02742 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GCNT1Q02742 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GCNT1Q02742 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GCNT1Q02742 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GCNT1Q02742 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GCNT1Q02742 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GCNT1Q02742 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GCNT1Q02742 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GCNT1Q02742 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GCNT1Q02742 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GCNT1Q02742 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GCNT1Q02742 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GCNT1Q02742 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GCNT1Q02742 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GCNT1Q02742 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GCNT1Q02742 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GCNT1Q02742 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
GCNT1Q02742 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GCNT1Q02742 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GCNT1Q02742 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GCNT1Q02742 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms