Protein–RNA interactions for Protein: Q02535

ID3, DNA-binding protein inhibitor ID-3, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ID3Q02535 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ID3Q02535 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ID3Q02535 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ID3Q02535 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ID3Q02535 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ID3Q02535 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ID3Q02535 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ID3Q02535 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ID3Q02535 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ID3Q02535 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ID3Q02535 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ID3Q02535 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ID3Q02535 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ID3Q02535 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ID3Q02535 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ID3Q02535 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ID3Q02535 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ID3Q02535 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ID3Q02535 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ID3Q02535 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ID3Q02535 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ID3Q02535 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ID3Q02535 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ID3Q02535 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ID3Q02535 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ID3Q02535 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ID3Q02535 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ID3Q02535 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ID3Q02535 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ID3Q02535 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ID3Q02535 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ID3Q02535 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ID3Q02535 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ID3Q02535 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ID3Q02535 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ID3Q02535 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ID3Q02535 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ID3Q02535 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ID3Q02535 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ID3Q02535 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ID3Q02535 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ID3Q02535 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ID3Q02535 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ID3Q02535 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ID3Q02535 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ID3Q02535 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ID3Q02535 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ID3Q02535 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ID3Q02535 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ID3Q02535 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ID3Q02535 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ID3Q02535 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ID3Q02535 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ID3Q02535 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ID3Q02535 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ID3Q02535 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ID3Q02535 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ID3Q02535 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ID3Q02535 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ID3Q02535 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ID3Q02535 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ID3Q02535 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ID3Q02535 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ID3Q02535 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ID3Q02535 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ID3Q02535 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ID3Q02535 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ID3Q02535 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ID3Q02535 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ID3Q02535 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ID3Q02535 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ID3Q02535 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ID3Q02535 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ID3Q02535 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ID3Q02535 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ID3Q02535 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ID3Q02535 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ID3Q02535 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ID3Q02535 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ID3Q02535 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ID3Q02535 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ID3Q02535 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ID3Q02535 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ID3Q02535 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ID3Q02535 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ID3Q02535 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ID3Q02535 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ID3Q02535 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ID3Q02535 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ID3Q02535 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ID3Q02535 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ID3Q02535 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ID3Q02535 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ID3Q02535 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ID3Q02535 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ID3Q02535 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ID3Q02535 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ID3Q02535 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ID3Q02535 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ID3Q02535 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms