Protein–RNA interactions for Protein: Q02246

CNTN2, Contactin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN2Q02246 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNTN2Q02246 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNTN2Q02246 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNTN2Q02246 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNTN2Q02246 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNTN2Q02246 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CNTN2Q02246 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNTN2Q02246 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CNTN2Q02246 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNTN2Q02246 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNTN2Q02246 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNTN2Q02246 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNTN2Q02246 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNTN2Q02246 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNTN2Q02246 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNTN2Q02246 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNTN2Q02246 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNTN2Q02246 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNTN2Q02246 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNTN2Q02246 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNTN2Q02246 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNTN2Q02246 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNTN2Q02246 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNTN2Q02246 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNTN2Q02246 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNTN2Q02246 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNTN2Q02246 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CNTN2Q02246 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNTN2Q02246 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNTN2Q02246 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNTN2Q02246 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNTN2Q02246 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNTN2Q02246 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNTN2Q02246 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNTN2Q02246 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNTN2Q02246 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNTN2Q02246 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNTN2Q02246 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNTN2Q02246 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNTN2Q02246 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNTN2Q02246 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNTN2Q02246 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNTN2Q02246 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNTN2Q02246 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNTN2Q02246 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNTN2Q02246 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNTN2Q02246 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNTN2Q02246 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNTN2Q02246 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNTN2Q02246 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNTN2Q02246 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNTN2Q02246 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNTN2Q02246 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNTN2Q02246 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CNTN2Q02246 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNTN2Q02246 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNTN2Q02246 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNTN2Q02246 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CNTN2Q02246 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNTN2Q02246 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNTN2Q02246 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNTN2Q02246 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNTN2Q02246 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNTN2Q02246 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNTN2Q02246 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNTN2Q02246 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CNTN2Q02246 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNTN2Q02246 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNTN2Q02246 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNTN2Q02246 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNTN2Q02246 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNTN2Q02246 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNTN2Q02246 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNTN2Q02246 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNTN2Q02246 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNTN2Q02246 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNTN2Q02246 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNTN2Q02246 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNTN2Q02246 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNTN2Q02246 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNTN2Q02246 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNTN2Q02246 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNTN2Q02246 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNTN2Q02246 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNTN2Q02246 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNTN2Q02246 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNTN2Q02246 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNTN2Q02246 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNTN2Q02246 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNTN2Q02246 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNTN2Q02246 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNTN2Q02246 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNTN2Q02246 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNTN2Q02246 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CNTN2Q02246 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNTN2Q02246 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNTN2Q02246 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNTN2Q02246 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CNTN2Q02246 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CNTN2Q02246 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms