Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK3Q00526 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK3Q00526 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK3Q00526 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK3Q00526 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK3Q00526 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK3Q00526 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK3Q00526 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK3Q00526 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK3Q00526 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK3Q00526 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK3Q00526 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK3Q00526 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK3Q00526 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK3Q00526 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK3Q00526 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK3Q00526 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK3Q00526 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK3Q00526 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK3Q00526 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK3Q00526 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK3Q00526 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK3Q00526 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK3Q00526 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK3Q00526 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK3Q00526 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK3Q00526 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK3Q00526 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK3Q00526 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK3Q00526 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK3Q00526 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK3Q00526 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK3Q00526 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK3Q00526 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK3Q00526 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK3Q00526 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK3Q00526 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK3Q00526 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK3Q00526 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK3Q00526 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK3Q00526 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK3Q00526 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK3Q00526 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK3Q00526 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK3Q00526 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK3Q00526 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK3Q00526 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK3Q00526 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK3Q00526 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK3Q00526 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK3Q00526 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK3Q00526 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK3Q00526 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK3Q00526 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK3Q00526 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK3Q00526 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK3Q00526 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK3Q00526 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK3Q00526 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK3Q00526 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK3Q00526 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK3Q00526 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK3Q00526 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK3Q00526 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK3Q00526 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK3Q00526 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK3Q00526 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK3Q00526 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDK3Q00526 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDK3Q00526 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDK3Q00526 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDK3Q00526 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK3Q00526 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK3Q00526 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK3Q00526 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK3Q00526 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK3Q00526 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK3Q00526 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK3Q00526 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK3Q00526 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK3Q00526 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK3Q00526 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK3Q00526 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK3Q00526 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK3Q00526 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK3Q00526 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK3Q00526 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK3Q00526 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK3Q00526 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK3Q00526 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK3Q00526 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK3Q00526 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK3Q00526 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK3Q00526 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK3Q00526 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK3Q00526 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK3Q00526 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK3Q00526 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK3Q00526 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK3Q00526 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms