Protein–RNA interactions for Protein: P78549

NTHL1, Endonuclease III-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTHL1P78549 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NTHL1P78549 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NTHL1P78549 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NTHL1P78549 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NTHL1P78549 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NTHL1P78549 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NTHL1P78549 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NTHL1P78549 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NTHL1P78549 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NTHL1P78549 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NTHL1P78549 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NTHL1P78549 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NTHL1P78549 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NTHL1P78549 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NTHL1P78549 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NTHL1P78549 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NTHL1P78549 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NTHL1P78549 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NTHL1P78549 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NTHL1P78549 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NTHL1P78549 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NTHL1P78549 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NTHL1P78549 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NTHL1P78549 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NTHL1P78549 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NTHL1P78549 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NTHL1P78549 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NTHL1P78549 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NTHL1P78549 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NTHL1P78549 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NTHL1P78549 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NTHL1P78549 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NTHL1P78549 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NTHL1P78549 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NTHL1P78549 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NTHL1P78549 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NTHL1P78549 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NTHL1P78549 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NTHL1P78549 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NTHL1P78549 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NTHL1P78549 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NTHL1P78549 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NTHL1P78549 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NTHL1P78549 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NTHL1P78549 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NTHL1P78549 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NTHL1P78549 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NTHL1P78549 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NTHL1P78549 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NTHL1P78549 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NTHL1P78549 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NTHL1P78549 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NTHL1P78549 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NTHL1P78549 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NTHL1P78549 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NTHL1P78549 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NTHL1P78549 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NTHL1P78549 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NTHL1P78549 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NTHL1P78549 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NTHL1P78549 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NTHL1P78549 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NTHL1P78549 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NTHL1P78549 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NTHL1P78549 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NTHL1P78549 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NTHL1P78549 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NTHL1P78549 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NTHL1P78549 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NTHL1P78549 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NTHL1P78549 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NTHL1P78549 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NTHL1P78549 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NTHL1P78549 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NTHL1P78549 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NTHL1P78549 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NTHL1P78549 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NTHL1P78549 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NTHL1P78549 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NTHL1P78549 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NTHL1P78549 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NTHL1P78549 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NTHL1P78549 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NTHL1P78549 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NTHL1P78549 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NTHL1P78549 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NTHL1P78549 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NTHL1P78549 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NTHL1P78549 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NTHL1P78549 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NTHL1P78549 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NTHL1P78549 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NTHL1P78549 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NTHL1P78549 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NTHL1P78549 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NTHL1P78549 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NTHL1P78549 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NTHL1P78549 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NTHL1P78549 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NTHL1P78549 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms