Protein–RNA interactions for Protein: P78415

IRX3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX3P78415 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
IRX3P78415 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
IRX3P78415 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
IRX3P78415 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
IRX3P78415 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
IRX3P78415 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
IRX3P78415 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
IRX3P78415 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
IRX3P78415 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
IRX3P78415 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
IRX3P78415 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
IRX3P78415 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
IRX3P78415 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
IRX3P78415 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
IRX3P78415 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
IRX3P78415 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
IRX3P78415 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
IRX3P78415 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
IRX3P78415 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
IRX3P78415 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
IRX3P78415 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
IRX3P78415 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
IRX3P78415 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
IRX3P78415 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
IRX3P78415 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
IRX3P78415 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
IRX3P78415 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
IRX3P78415 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
IRX3P78415 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
IRX3P78415 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
IRX3P78415 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
IRX3P78415 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
IRX3P78415 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
IRX3P78415 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
IRX3P78415 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
IRX3P78415 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
IRX3P78415 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
IRX3P78415 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
IRX3P78415 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
IRX3P78415 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
IRX3P78415 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
IRX3P78415 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
IRX3P78415 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
IRX3P78415 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
IRX3P78415 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
IRX3P78415 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
IRX3P78415 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
IRX3P78415 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
IRX3P78415 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
IRX3P78415 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
IRX3P78415 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
IRX3P78415 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
IRX3P78415 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
IRX3P78415 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
IRX3P78415 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
IRX3P78415 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
IRX3P78415 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
IRX3P78415 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
IRX3P78415 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
IRX3P78415 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
IRX3P78415 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
IRX3P78415 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
IRX3P78415 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
IRX3P78415 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
IRX3P78415 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
IRX3P78415 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
IRX3P78415 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
IRX3P78415 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
IRX3P78415 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
IRX3P78415 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
IRX3P78415 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
IRX3P78415 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
IRX3P78415 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
IRX3P78415 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
IRX3P78415 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
IRX3P78415 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
IRX3P78415 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
IRX3P78415 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
IRX3P78415 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
IRX3P78415 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
IRX3P78415 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
IRX3P78415 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
IRX3P78415 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
IRX3P78415 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
IRX3P78415 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
IRX3P78415 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
IRX3P78415 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
IRX3P78415 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
IRX3P78415 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
IRX3P78415 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
IRX3P78415 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
IRX3P78415 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
IRX3P78415 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
IRX3P78415 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
IRX3P78415 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
IRX3P78415 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC26■■□□□ 1.75
IRX3P78415 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
IRX3P78415 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
IRX3P78415 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
IRX3P78415 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms