Protein–RNA interactions for Protein: P78396

CCNA1, Cyclin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA1P78396 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCNA1P78396 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCNA1P78396 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCNA1P78396 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCNA1P78396 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCNA1P78396 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCNA1P78396 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCNA1P78396 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CCNA1P78396 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCNA1P78396 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCNA1P78396 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCNA1P78396 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCNA1P78396 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCNA1P78396 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCNA1P78396 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCNA1P78396 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCNA1P78396 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCNA1P78396 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCNA1P78396 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCNA1P78396 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCNA1P78396 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCNA1P78396 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCNA1P78396 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCNA1P78396 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CCNA1P78396 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCNA1P78396 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCNA1P78396 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CCNA1P78396 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCNA1P78396 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CCNA1P78396 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCNA1P78396 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCNA1P78396 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCNA1P78396 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCNA1P78396 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCNA1P78396 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCNA1P78396 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCNA1P78396 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCNA1P78396 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CCNA1P78396 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CCNA1P78396 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCNA1P78396 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
CCNA1P78396 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCNA1P78396 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCNA1P78396 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCNA1P78396 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCNA1P78396 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCNA1P78396 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCNA1P78396 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCNA1P78396 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCNA1P78396 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCNA1P78396 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCNA1P78396 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCNA1P78396 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCNA1P78396 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCNA1P78396 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCNA1P78396 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCNA1P78396 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCNA1P78396 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCNA1P78396 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCNA1P78396 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCNA1P78396 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCNA1P78396 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCNA1P78396 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CCNA1P78396 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCNA1P78396 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCNA1P78396 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCNA1P78396 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCNA1P78396 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCNA1P78396 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CCNA1P78396 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CCNA1P78396 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CCNA1P78396 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCNA1P78396 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCNA1P78396 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCNA1P78396 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCNA1P78396 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CCNA1P78396 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCNA1P78396 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCNA1P78396 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CCNA1P78396 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCNA1P78396 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCNA1P78396 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCNA1P78396 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCNA1P78396 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCNA1P78396 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CCNA1P78396 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCNA1P78396 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCNA1P78396 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCNA1P78396 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCNA1P78396 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCNA1P78396 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCNA1P78396 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCNA1P78396 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCNA1P78396 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCNA1P78396 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCNA1P78396 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCNA1P78396 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCNA1P78396 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCNA1P78396 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCNA1P78396 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms