Protein–RNA interactions for Protein: P78386

KRT85, Keratin, type II cuticular Hb5, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT85P78386 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT85P78386 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT85P78386 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT85P78386 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT85P78386 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT85P78386 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT85P78386 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT85P78386 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KRT85P78386 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KRT85P78386 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KRT85P78386 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
KRT85P78386 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
KRT85P78386 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KRT85P78386 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT85P78386 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT85P78386 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT85P78386 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT85P78386 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT85P78386 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT85P78386 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT85P78386 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT85P78386 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT85P78386 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT85P78386 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT85P78386 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT85P78386 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
KRT85P78386 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
KRT85P78386 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
KRT85P78386 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT85P78386 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT85P78386 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT85P78386 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT85P78386 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT85P78386 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT85P78386 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT85P78386 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT85P78386 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT85P78386 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT85P78386 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT85P78386 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT85P78386 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT85P78386 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT85P78386 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT85P78386 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT85P78386 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT85P78386 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT85P78386 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT85P78386 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT85P78386 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT85P78386 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT85P78386 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT85P78386 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT85P78386 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT85P78386 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT85P78386 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT85P78386 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT85P78386 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT85P78386 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT85P78386 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT85P78386 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT85P78386 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT85P78386 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT85P78386 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT85P78386 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT85P78386 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT85P78386 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT85P78386 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT85P78386 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT85P78386 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT85P78386 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT85P78386 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT85P78386 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT85P78386 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT85P78386 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT85P78386 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT85P78386 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT85P78386 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT85P78386 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT85P78386 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT85P78386 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT85P78386 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT85P78386 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT85P78386 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT85P78386 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT85P78386 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT85P78386 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT85P78386 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT85P78386 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT85P78386 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT85P78386 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT85P78386 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT85P78386 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT85P78386 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT85P78386 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT85P78386 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT85P78386 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT85P78386 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT85P78386 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT85P78386 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT85P78386 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms