Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACTA1P68133 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACTA1P68133 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACTA1P68133 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACTA1P68133 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACTA1P68133 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACTA1P68133 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACTA1P68133 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACTA1P68133 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACTA1P68133 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACTA1P68133 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACTA1P68133 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACTA1P68133 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACTA1P68133 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACTA1P68133 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACTA1P68133 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ACTA1P68133 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ACTA1P68133 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ACTA1P68133 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ACTA1P68133 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ACTA1P68133 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ACTA1P68133 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ACTA1P68133 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ACTA1P68133 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ACTA1P68133 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ACTA1P68133 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACTA1P68133 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACTA1P68133 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACTA1P68133 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACTA1P68133 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACTA1P68133 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACTA1P68133 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACTA1P68133 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACTA1P68133 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACTA1P68133 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACTA1P68133 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACTA1P68133 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACTA1P68133 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACTA1P68133 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACTA1P68133 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACTA1P68133 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACTA1P68133 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACTA1P68133 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACTA1P68133 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACTA1P68133 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACTA1P68133 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACTA1P68133 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACTA1P68133 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACTA1P68133 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACTA1P68133 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ACTA1P68133 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACTA1P68133 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACTA1P68133 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
ACTA1P68133 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ACTA1P68133 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ACTA1P68133 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ACTA1P68133 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ACTA1P68133 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ACTA1P68133 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ACTA1P68133 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ACTA1P68133 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ACTA1P68133 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ACTA1P68133 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ACTA1P68133 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ACTA1P68133 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACTA1P68133 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACTA1P68133 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACTA1P68133 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACTA1P68133 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACTA1P68133 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACTA1P68133 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACTA1P68133 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACTA1P68133 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACTA1P68133 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACTA1P68133 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACTA1P68133 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACTA1P68133 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACTA1P68133 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACTA1P68133 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACTA1P68133 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACTA1P68133 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACTA1P68133 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ACTA1P68133 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ACTA1P68133 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ACTA1P68133 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ACTA1P68133 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ACTA1P68133 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ACTA1P68133 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ACTA1P68133 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ACTA1P68133 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ACTA1P68133 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ACTA1P68133 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ACTA1P68133 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ACTA1P68133 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ACTA1P68133 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ACTA1P68133 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ACTA1P68133 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ACTA1P68133 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ACTA1P68133 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ACTA1P68133 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms