Protein–RNA interactions for Protein: P62891

RPL39, 60S ribosomal protein L39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P62891 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPL39P62891 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RPL39P62891 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPL39P62891 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPL39P62891 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPL39P62891 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPL39P62891 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPL39P62891 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPL39P62891 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPL39P62891 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPL39P62891 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPL39P62891 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL39P62891 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL39P62891 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL39P62891 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL39P62891 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL39P62891 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL39P62891 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL39P62891 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL39P62891 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL39P62891 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL39P62891 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL39P62891 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL39P62891 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL39P62891 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL39P62891 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL39P62891 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL39P62891 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL39P62891 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL39P62891 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL39P62891 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL39P62891 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL39P62891 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL39P62891 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL39P62891 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL39P62891 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL39P62891 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL39P62891 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL39P62891 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL39P62891 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL39P62891 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL39P62891 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL39P62891 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL39P62891 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL39P62891 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL39P62891 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL39P62891 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL39P62891 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL39P62891 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL39P62891 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL39P62891 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL39P62891 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL39P62891 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL39P62891 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL39P62891 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL39P62891 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL39P62891 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL39P62891 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL39P62891 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL39P62891 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL39P62891 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL39P62891 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL39P62891 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL39P62891 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL39P62891 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL39P62891 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL39P62891 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL39P62891 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL39P62891 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL39P62891 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL39P62891 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL39P62891 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL39P62891 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL39P62891 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL39P62891 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL39P62891 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL39P62891 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL39P62891 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL39P62891 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPL39P62891 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPL39P62891 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPL39P62891 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPL39P62891 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPL39P62891 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPL39P62891 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPL39P62891 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL39P62891 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL39P62891 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL39P62891 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL39P62891 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL39P62891 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL39P62891 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL39P62891 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL39P62891 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL39P62891 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL39P62891 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL39P62891 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL39P62891 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL39P62891 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL39P62891 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms