Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
UFM1P61960 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UFM1P61960 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UFM1P61960 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UFM1P61960 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UFM1P61960 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
UFM1P61960 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UFM1P61960 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UFM1P61960 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UFM1P61960 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
UFM1P61960 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
UFM1P61960 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UFM1P61960 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UFM1P61960 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UFM1P61960 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UFM1P61960 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UFM1P61960 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UFM1P61960 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UFM1P61960 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UFM1P61960 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UFM1P61960 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UFM1P61960 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UFM1P61960 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UFM1P61960 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UFM1P61960 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UFM1P61960 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UFM1P61960 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
UFM1P61960 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UFM1P61960 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UFM1P61960 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
UFM1P61960 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UFM1P61960 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UFM1P61960 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UFM1P61960 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UFM1P61960 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UFM1P61960 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UFM1P61960 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UFM1P61960 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UFM1P61960 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UFM1P61960 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
UFM1P61960 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UFM1P61960 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UFM1P61960 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UFM1P61960 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UFM1P61960 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UFM1P61960 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UFM1P61960 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UFM1P61960 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UFM1P61960 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
UFM1P61960 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UFM1P61960 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UFM1P61960 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UFM1P61960 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UFM1P61960 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UFM1P61960 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UFM1P61960 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UFM1P61960 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
UFM1P61960 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UFM1P61960 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UFM1P61960 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UFM1P61960 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
UFM1P61960 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UFM1P61960 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UFM1P61960 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UFM1P61960 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UFM1P61960 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UFM1P61960 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UFM1P61960 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UFM1P61960 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UFM1P61960 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UFM1P61960 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UFM1P61960 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UFM1P61960 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UFM1P61960 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UFM1P61960 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UFM1P61960 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UFM1P61960 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UFM1P61960 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UFM1P61960 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
UFM1P61960 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
UFM1P61960 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
UFM1P61960 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
UFM1P61960 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
UFM1P61960 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
UFM1P61960 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
UFM1P61960 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UFM1P61960 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UFM1P61960 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UFM1P61960 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UFM1P61960 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UFM1P61960 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UFM1P61960 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UFM1P61960 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UFM1P61960 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UFM1P61960 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UFM1P61960 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UFM1P61960 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UFM1P61960 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UFM1P61960 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UFM1P61960 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms