Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
VBP1P61758 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
VBP1P61758 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
VBP1P61758 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VBP1P61758 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
VBP1P61758 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
VBP1P61758 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VBP1P61758 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VBP1P61758 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VBP1P61758 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VBP1P61758 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VBP1P61758 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VBP1P61758 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VBP1P61758 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VBP1P61758 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VBP1P61758 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VBP1P61758 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VBP1P61758 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VBP1P61758 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VBP1P61758 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VBP1P61758 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VBP1P61758 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VBP1P61758 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VBP1P61758 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VBP1P61758 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VBP1P61758 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VBP1P61758 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VBP1P61758 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VBP1P61758 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VBP1P61758 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VBP1P61758 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VBP1P61758 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VBP1P61758 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
VBP1P61758 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VBP1P61758 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VBP1P61758 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VBP1P61758 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VBP1P61758 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VBP1P61758 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VBP1P61758 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VBP1P61758 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VBP1P61758 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VBP1P61758 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VBP1P61758 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VBP1P61758 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VBP1P61758 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VBP1P61758 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VBP1P61758 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VBP1P61758 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
VBP1P61758 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
VBP1P61758 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VBP1P61758 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VBP1P61758 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
VBP1P61758 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VBP1P61758 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
VBP1P61758 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VBP1P61758 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VBP1P61758 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VBP1P61758 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VBP1P61758 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VBP1P61758 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VBP1P61758 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VBP1P61758 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
VBP1P61758 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
VBP1P61758 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VBP1P61758 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VBP1P61758 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VBP1P61758 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VBP1P61758 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VBP1P61758 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VBP1P61758 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
VBP1P61758 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VBP1P61758 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VBP1P61758 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
VBP1P61758 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
VBP1P61758 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VBP1P61758 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VBP1P61758 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
VBP1P61758 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
VBP1P61758 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
VBP1P61758 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
VBP1P61758 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
VBP1P61758 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VBP1P61758 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VBP1P61758 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VBP1P61758 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VBP1P61758 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VBP1P61758 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VBP1P61758 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VBP1P61758 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VBP1P61758 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VBP1P61758 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VBP1P61758 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
VBP1P61758 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VBP1P61758 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VBP1P61758 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VBP1P61758 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VBP1P61758 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VBP1P61758 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VBP1P61758 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms