Protein–RNA interactions for Protein: P61201

COPS2, COP9 signalosome complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS2P61201 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COPS2P61201 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COPS2P61201 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COPS2P61201 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COPS2P61201 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COPS2P61201 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COPS2P61201 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
COPS2P61201 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COPS2P61201 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COPS2P61201 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COPS2P61201 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COPS2P61201 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COPS2P61201 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COPS2P61201 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COPS2P61201 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COPS2P61201 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COPS2P61201 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COPS2P61201 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COPS2P61201 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COPS2P61201 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
COPS2P61201 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COPS2P61201 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COPS2P61201 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COPS2P61201 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COPS2P61201 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COPS2P61201 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COPS2P61201 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COPS2P61201 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COPS2P61201 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COPS2P61201 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COPS2P61201 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COPS2P61201 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COPS2P61201 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COPS2P61201 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COPS2P61201 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COPS2P61201 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COPS2P61201 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COPS2P61201 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COPS2P61201 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COPS2P61201 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COPS2P61201 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COPS2P61201 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COPS2P61201 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COPS2P61201 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COPS2P61201 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COPS2P61201 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COPS2P61201 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COPS2P61201 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COPS2P61201 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COPS2P61201 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COPS2P61201 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
COPS2P61201 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COPS2P61201 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COPS2P61201 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
COPS2P61201 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COPS2P61201 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COPS2P61201 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COPS2P61201 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COPS2P61201 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COPS2P61201 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COPS2P61201 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COPS2P61201 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COPS2P61201 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COPS2P61201 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COPS2P61201 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COPS2P61201 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COPS2P61201 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COPS2P61201 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
COPS2P61201 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COPS2P61201 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COPS2P61201 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COPS2P61201 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COPS2P61201 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COPS2P61201 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COPS2P61201 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COPS2P61201 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COPS2P61201 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COPS2P61201 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
COPS2P61201 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
COPS2P61201 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COPS2P61201 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COPS2P61201 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COPS2P61201 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COPS2P61201 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COPS2P61201 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COPS2P61201 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COPS2P61201 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COPS2P61201 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COPS2P61201 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COPS2P61201 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COPS2P61201 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
COPS2P61201 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COPS2P61201 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COPS2P61201 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COPS2P61201 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COPS2P61201 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COPS2P61201 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COPS2P61201 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COPS2P61201 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COPS2P61201 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms