Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNAP25P60880 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNAP25P60880 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNAP25P60880 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNAP25P60880 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SNAP25P60880 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNAP25P60880 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNAP25P60880 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNAP25P60880 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNAP25P60880 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNAP25P60880 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNAP25P60880 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNAP25P60880 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNAP25P60880 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNAP25P60880 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNAP25P60880 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNAP25P60880 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNAP25P60880 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNAP25P60880 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SNAP25P60880 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SNAP25P60880 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SNAP25P60880 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SNAP25P60880 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SNAP25P60880 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SNAP25P60880 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SNAP25P60880 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SNAP25P60880 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SNAP25P60880 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SNAP25P60880 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SNAP25P60880 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNAP25P60880 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNAP25P60880 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNAP25P60880 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNAP25P60880 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNAP25P60880 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNAP25P60880 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SNAP25P60880 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNAP25P60880 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNAP25P60880 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNAP25P60880 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNAP25P60880 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNAP25P60880 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNAP25P60880 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNAP25P60880 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNAP25P60880 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNAP25P60880 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SNAP25P60880 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SNAP25P60880 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNAP25P60880 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNAP25P60880 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNAP25P60880 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNAP25P60880 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SNAP25P60880 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNAP25P60880 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNAP25P60880 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNAP25P60880 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNAP25P60880 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNAP25P60880 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNAP25P60880 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNAP25P60880 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNAP25P60880 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNAP25P60880 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNAP25P60880 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNAP25P60880 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNAP25P60880 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNAP25P60880 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNAP25P60880 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNAP25P60880 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SNAP25P60880 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNAP25P60880 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNAP25P60880 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SNAP25P60880 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNAP25P60880 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNAP25P60880 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNAP25P60880 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SNAP25P60880 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SNAP25P60880 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SNAP25P60880 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SNAP25P60880 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SNAP25P60880 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SNAP25P60880 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SNAP25P60880 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SNAP25P60880 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SNAP25P60880 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNAP25P60880 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNAP25P60880 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNAP25P60880 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNAP25P60880 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNAP25P60880 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNAP25P60880 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SNAP25P60880 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNAP25P60880 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNAP25P60880 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNAP25P60880 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNAP25P60880 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNAP25P60880 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNAP25P60880 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNAP25P60880 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNAP25P60880 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNAP25P60880 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms