Protein–RNA interactions for Protein: P60510

PPP4C, Serine/threonine-protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4CP60510 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PPP4CP60510 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PPP4CP60510 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PPP4CP60510 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PPP4CP60510 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PPP4CP60510 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PPP4CP60510 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PPP4CP60510 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PPP4CP60510 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PPP4CP60510 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PPP4CP60510 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PPP4CP60510 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PPP4CP60510 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PPP4CP60510 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PPP4CP60510 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PPP4CP60510 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PPP4CP60510 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PPP4CP60510 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PPP4CP60510 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PPP4CP60510 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PPP4CP60510 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PPP4CP60510 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PPP4CP60510 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PPP4CP60510 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PPP4CP60510 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PPP4CP60510 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PPP4CP60510 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PPP4CP60510 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PPP4CP60510 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PPP4CP60510 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PPP4CP60510 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PPP4CP60510 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PPP4CP60510 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PPP4CP60510 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PPP4CP60510 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PPP4CP60510 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PPP4CP60510 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PPP4CP60510 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
PPP4CP60510 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PPP4CP60510 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PPP4CP60510 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PPP4CP60510 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PPP4CP60510 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PPP4CP60510 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PPP4CP60510 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PPP4CP60510 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PPP4CP60510 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PPP4CP60510 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PPP4CP60510 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PPP4CP60510 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PPP4CP60510 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PPP4CP60510 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PPP4CP60510 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PPP4CP60510 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PPP4CP60510 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPP4CP60510 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPP4CP60510 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPP4CP60510 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPP4CP60510 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPP4CP60510 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPP4CP60510 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPP4CP60510 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPP4CP60510 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPP4CP60510 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPP4CP60510 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PPP4CP60510 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PPP4CP60510 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PPP4CP60510 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PPP4CP60510 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PPP4CP60510 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PPP4CP60510 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PPP4CP60510 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PPP4CP60510 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PPP4CP60510 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PPP4CP60510 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PPP4CP60510 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PPP4CP60510 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PPP4CP60510 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PPP4CP60510 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PPP4CP60510 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PPP4CP60510 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PPP4CP60510 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PPP4CP60510 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PPP4CP60510 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PPP4CP60510 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PPP4CP60510 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PPP4CP60510 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PPP4CP60510 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PPP4CP60510 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PPP4CP60510 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PPP4CP60510 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PPP4CP60510 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PPP4CP60510 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PPP4CP60510 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PPP4CP60510 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PPP4CP60510 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PPP4CP60510 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PPP4CP60510 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PPP4CP60510 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PPP4CP60510 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms