Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ERVFC1P60507 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ERVFC1P60507 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ERVFC1P60507 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ERVFC1P60507 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ERVFC1P60507 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ERVFC1P60507 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ERVFC1P60507 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ERVFC1P60507 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ERVFC1P60507 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ERVFC1P60507 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ERVFC1P60507 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ERVFC1P60507 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ERVFC1P60507 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ERVFC1P60507 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ERVFC1P60507 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ERVFC1P60507 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ERVFC1P60507 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ERVFC1P60507 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ERVFC1P60507 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ERVFC1P60507 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ERVFC1P60507 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ERVFC1P60507 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ERVFC1P60507 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ERVFC1P60507 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ERVFC1P60507 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ERVFC1P60507 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ERVFC1P60507 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ERVFC1P60507 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ERVFC1P60507 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ERVFC1P60507 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ERVFC1P60507 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ERVFC1P60507 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ERVFC1P60507 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ERVFC1P60507 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ERVFC1P60507 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ERVFC1P60507 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ERVFC1P60507 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ERVFC1P60507 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ERVFC1P60507 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ERVFC1P60507 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ERVFC1P60507 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ERVFC1P60507 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ERVFC1P60507 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ERVFC1P60507 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ERVFC1P60507 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ERVFC1P60507 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ERVFC1P60507 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ERVFC1P60507 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ERVFC1P60507 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ERVFC1P60507 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ERVFC1P60507 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ERVFC1P60507 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ERVFC1P60507 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ERVFC1P60507 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ERVFC1P60507 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ERVFC1P60507 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ERVFC1P60507 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ERVFC1P60507 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ERVFC1P60507 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ERVFC1P60507 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ERVFC1P60507 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ERVFC1P60507 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ERVFC1P60507 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ERVFC1P60507 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ERVFC1P60507 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ERVFC1P60507 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ERVFC1P60507 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ERVFC1P60507 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ERVFC1P60507 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ERVFC1P60507 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERVFC1P60507 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERVFC1P60507 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERVFC1P60507 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERVFC1P60507 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERVFC1P60507 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERVFC1P60507 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERVFC1P60507 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERVFC1P60507 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERVFC1P60507 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERVFC1P60507 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ERVFC1P60507 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ERVFC1P60507 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ERVFC1P60507 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ERVFC1P60507 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ERVFC1P60507 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ERVFC1P60507 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ERVFC1P60507 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ERVFC1P60507 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ERVFC1P60507 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ERVFC1P60507 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ERVFC1P60507 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ERVFC1P60507 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
ERVFC1P60507 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ERVFC1P60507 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ERVFC1P60507 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ERVFC1P60507 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ERVFC1P60507 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ERVFC1P60507 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ERVFC1P60507 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms