Protein–RNA interactions for Protein: P60484

PTEN, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate 3-phosphatase and dual-specificity protein phosphatase PTEN, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTENP60484 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTENP60484 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTENP60484 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTENP60484 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTENP60484 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PTENP60484 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PTENP60484 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTENP60484 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTENP60484 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTENP60484 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTENP60484 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PTENP60484 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTENP60484 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTENP60484 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTENP60484 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTENP60484 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTENP60484 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTENP60484 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PTENP60484 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTENP60484 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PTENP60484 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PTENP60484 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PTENP60484 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTENP60484 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTENP60484 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTENP60484 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTENP60484 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTENP60484 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTENP60484 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTENP60484 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTENP60484 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTENP60484 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTENP60484 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTENP60484 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTENP60484 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTENP60484 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PTENP60484 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTENP60484 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTENP60484 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTENP60484 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTENP60484 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTENP60484 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTENP60484 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTENP60484 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTENP60484 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTENP60484 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTENP60484 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTENP60484 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PTENP60484 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTENP60484 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTENP60484 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTENP60484 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTENP60484 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTENP60484 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PTENP60484 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTENP60484 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PTENP60484 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTENP60484 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTENP60484 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTENP60484 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PTENP60484 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTENP60484 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTENP60484 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTENP60484 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTENP60484 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTENP60484 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTENP60484 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTENP60484 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTENP60484 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTENP60484 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTENP60484 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PTENP60484 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PTENP60484 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PTENP60484 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PTENP60484 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PTENP60484 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTENP60484 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTENP60484 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTENP60484 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTENP60484 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTENP60484 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTENP60484 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTENP60484 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTENP60484 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTENP60484 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTENP60484 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PTENP60484 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTENP60484 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTENP60484 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTENP60484 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTENP60484 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTENP60484 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PTENP60484 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTENP60484 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PTENP60484 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTENP60484 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTENP60484 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
PTENP60484 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTENP60484 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTENP60484 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms