Protein–RNA interactions for Protein: P59091

LINC00315, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00315, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00315P59091 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00315P59091 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00315P59091 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00315P59091 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00315P59091 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00315P59091 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00315P59091 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00315P59091 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00315P59091 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00315P59091 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00315P59091 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00315P59091 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00315P59091 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00315P59091 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00315P59091 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00315P59091 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00315P59091 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00315P59091 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00315P59091 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00315P59091 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00315P59091 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00315P59091 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00315P59091 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00315P59091 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00315P59091 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00315P59091 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00315P59091 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00315P59091 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00315P59091 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00315P59091 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
LINC00315P59091 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
LINC00315P59091 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00315P59091 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00315P59091 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00315P59091 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00315P59091 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00315P59091 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00315P59091 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00315P59091 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00315P59091 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00315P59091 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00315P59091 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00315P59091 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00315P59091 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00315P59091 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00315P59091 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00315P59091 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00315P59091 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00315P59091 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00315P59091 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00315P59091 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00315P59091 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00315P59091 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00315P59091 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00315P59091 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00315P59091 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00315P59091 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00315P59091 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00315P59091 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00315P59091 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00315P59091 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00315P59091 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00315P59091 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00315P59091 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00315P59091 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00315P59091 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00315P59091 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00315P59091 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00315P59091 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00315P59091 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00315P59091 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00315P59091 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00315P59091 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00315P59091 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00315P59091 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00315P59091 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00315P59091 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00315P59091 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00315P59091 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00315P59091 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00315P59091 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00315P59091 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00315P59091 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00315P59091 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00315P59091 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00315P59091 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00315P59091 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00315P59091 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00315P59091 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00315P59091 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00315P59091 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00315P59091 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00315P59091 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00315P59091 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00315P59091 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00315P59091 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00315P59091 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00315P59091 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00315P59091 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00315P59091 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms