Protein–RNA interactions for Protein: P56180

TPTE, Putative tyrosine-protein phosphatase TPTE, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTEP56180 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TPTEP56180 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TPTEP56180 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TPTEP56180 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TPTEP56180 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TPTEP56180 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TPTEP56180 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TPTEP56180 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TPTEP56180 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TPTEP56180 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TPTEP56180 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TPTEP56180 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TPTEP56180 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TPTEP56180 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TPTEP56180 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TPTEP56180 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TPTEP56180 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TPTEP56180 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TPTEP56180 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TPTEP56180 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TPTEP56180 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TPTEP56180 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TPTEP56180 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TPTEP56180 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TPTEP56180 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TPTEP56180 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TPTEP56180 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TPTEP56180 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TPTEP56180 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
TPTEP56180 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
TPTEP56180 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TPTEP56180 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TPTEP56180 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TPTEP56180 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TPTEP56180 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TPTEP56180 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TPTEP56180 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TPTEP56180 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TPTEP56180 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TPTEP56180 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TPTEP56180 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TPTEP56180 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TPTEP56180 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TPTEP56180 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TPTEP56180 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TPTEP56180 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TPTEP56180 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TPTEP56180 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TPTEP56180 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TPTEP56180 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TPTEP56180 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TPTEP56180 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TPTEP56180 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TPTEP56180 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TPTEP56180 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TPTEP56180 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TPTEP56180 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TPTEP56180 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPTEP56180 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPTEP56180 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPTEP56180 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPTEP56180 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPTEP56180 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPTEP56180 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPTEP56180 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPTEP56180 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPTEP56180 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPTEP56180 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPTEP56180 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPTEP56180 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPTEP56180 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPTEP56180 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TPTEP56180 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TPTEP56180 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TPTEP56180 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TPTEP56180 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TPTEP56180 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TPTEP56180 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TPTEP56180 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TPTEP56180 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TPTEP56180 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TPTEP56180 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TPTEP56180 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TPTEP56180 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TPTEP56180 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TPTEP56180 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TPTEP56180 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TPTEP56180 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TPTEP56180 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TPTEP56180 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TPTEP56180 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TPTEP56180 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TPTEP56180 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TPTEP56180 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TPTEP56180 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TPTEP56180 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TPTEP56180 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TPTEP56180 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TPTEP56180 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TPTEP56180 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms