Protein–RNA interactions for Protein: P55771

PAX9, Paired box protein Pax-9, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX9P55771 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAX9P55771 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAX9P55771 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAX9P55771 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PAX9P55771 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PAX9P55771 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PAX9P55771 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PAX9P55771 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PAX9P55771 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PAX9P55771 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PAX9P55771 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PAX9P55771 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PAX9P55771 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PAX9P55771 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PAX9P55771 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PAX9P55771 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PAX9P55771 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PAX9P55771 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PAX9P55771 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PAX9P55771 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PAX9P55771 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAX9P55771 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAX9P55771 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAX9P55771 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAX9P55771 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAX9P55771 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAX9P55771 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAX9P55771 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAX9P55771 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAX9P55771 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAX9P55771 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAX9P55771 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAX9P55771 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PAX9P55771 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PAX9P55771 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PAX9P55771 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PAX9P55771 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PAX9P55771 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PAX9P55771 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PAX9P55771 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PAX9P55771 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PAX9P55771 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PAX9P55771 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAX9P55771 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PAX9P55771 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAX9P55771 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAX9P55771 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAX9P55771 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAX9P55771 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAX9P55771 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PAX9P55771 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAX9P55771 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAX9P55771 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAX9P55771 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAX9P55771 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAX9P55771 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAX9P55771 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAX9P55771 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAX9P55771 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAX9P55771 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAX9P55771 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAX9P55771 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAX9P55771 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAX9P55771 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAX9P55771 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAX9P55771 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAX9P55771 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAX9P55771 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAX9P55771 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAX9P55771 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAX9P55771 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAX9P55771 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAX9P55771 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAX9P55771 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAX9P55771 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAX9P55771 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAX9P55771 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAX9P55771 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAX9P55771 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAX9P55771 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAX9P55771 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAX9P55771 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAX9P55771 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAX9P55771 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAX9P55771 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAX9P55771 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAX9P55771 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAX9P55771 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAX9P55771 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAX9P55771 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAX9P55771 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAX9P55771 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAX9P55771 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAX9P55771 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAX9P55771 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAX9P55771 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PAX9P55771 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PAX9P55771 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PAX9P55771 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PAX9P55771 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms