Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CASP7P55210 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CASP7P55210 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CASP7P55210 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CASP7P55210 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CASP7P55210 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CASP7P55210 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CASP7P55210 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CASP7P55210 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CASP7P55210 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CASP7P55210 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CASP7P55210 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CASP7P55210 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CASP7P55210 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CASP7P55210 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CASP7P55210 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CASP7P55210 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CASP7P55210 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CASP7P55210 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CASP7P55210 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CASP7P55210 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CASP7P55210 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CASP7P55210 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CASP7P55210 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CASP7P55210 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CASP7P55210 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CASP7P55210 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CASP7P55210 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CASP7P55210 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CASP7P55210 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CASP7P55210 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CASP7P55210 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
CASP7P55210 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CASP7P55210 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CASP7P55210 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CASP7P55210 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CASP7P55210 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CASP7P55210 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CASP7P55210 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CASP7P55210 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CASP7P55210 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CASP7P55210 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CASP7P55210 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CASP7P55210 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CASP7P55210 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CASP7P55210 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CASP7P55210 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CASP7P55210 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CASP7P55210 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CASP7P55210 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CASP7P55210 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CASP7P55210 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CASP7P55210 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CASP7P55210 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CASP7P55210 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CASP7P55210 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CASP7P55210 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CASP7P55210 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CASP7P55210 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CASP7P55210 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CASP7P55210 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CASP7P55210 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CASP7P55210 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CASP7P55210 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CASP7P55210 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CASP7P55210 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CASP7P55210 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CASP7P55210 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CASP7P55210 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CASP7P55210 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CASP7P55210 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CASP7P55210 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CASP7P55210 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CASP7P55210 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CASP7P55210 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CASP7P55210 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CASP7P55210 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CASP7P55210 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CASP7P55210 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CASP7P55210 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CASP7P55210 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CASP7P55210 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CASP7P55210 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CASP7P55210 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CASP7P55210 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CASP7P55210 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CASP7P55210 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CASP7P55210 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CASP7P55210 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CASP7P55210 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CASP7P55210 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CASP7P55210 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CASP7P55210 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CASP7P55210 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CASP7P55210 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CASP7P55210 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CASP7P55210 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CASP7P55210 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CASP7P55210 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CASP7P55210 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms