Protein–RNA interactions for Protein: P55196

AFDN, Afadin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFDNP55196 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
AFDNP55196 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
AFDNP55196 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
AFDNP55196 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
AFDNP55196 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
AFDNP55196 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
AFDNP55196 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
AFDNP55196 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
AFDNP55196 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
AFDNP55196 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
AFDNP55196 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
AFDNP55196 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
AFDNP55196 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
AFDNP55196 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
AFDNP55196 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
AFDNP55196 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
AFDNP55196 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
AFDNP55196 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
AFDNP55196 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
AFDNP55196 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
AFDNP55196 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
AFDNP55196 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
AFDNP55196 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
AFDNP55196 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
AFDNP55196 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
AFDNP55196 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
AFDNP55196 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
AFDNP55196 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
AFDNP55196 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
AFDNP55196 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
AFDNP55196 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
AFDNP55196 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
AFDNP55196 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
AFDNP55196 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
AFDNP55196 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
AFDNP55196 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
AFDNP55196 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
AFDNP55196 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
AFDNP55196 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
AFDNP55196 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
AFDNP55196 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
AFDNP55196 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
AFDNP55196 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
AFDNP55196 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
AFDNP55196 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
AFDNP55196 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
AFDNP55196 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
AFDNP55196 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
AFDNP55196 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
AFDNP55196 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
AFDNP55196 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
AFDNP55196 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
AFDNP55196 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
AFDNP55196 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
AFDNP55196 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
AFDNP55196 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
AFDNP55196 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
AFDNP55196 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
AFDNP55196 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
AFDNP55196 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
AFDNP55196 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
AFDNP55196 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
AFDNP55196 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
AFDNP55196 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
AFDNP55196 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
AFDNP55196 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
AFDNP55196 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
AFDNP55196 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
AFDNP55196 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
AFDNP55196 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
AFDNP55196 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
AFDNP55196 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
AFDNP55196 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
AFDNP55196 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
AFDNP55196 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
AFDNP55196 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
AFDNP55196 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
AFDNP55196 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
AFDNP55196 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
AFDNP55196 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
AFDNP55196 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
AFDNP55196 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
AFDNP55196 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
AFDNP55196 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
AFDNP55196 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
AFDNP55196 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
AFDNP55196 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
AFDNP55196 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
AFDNP55196 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
AFDNP55196 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
AFDNP55196 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
AFDNP55196 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
AFDNP55196 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
AFDNP55196 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
AFDNP55196 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
AFDNP55196 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
AFDNP55196 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
AFDNP55196 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
AFDNP55196 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
AFDNP55196 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms